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毛細管柱分配色譜儀類型有多種。
1、按分離目的可分：化驗室毛細管柱分配色譜儀和工業毛細管柱分配色譜儀。
2、按功能可分：分析型毛細管柱分配色譜儀和制備型毛細管柱分配色譜儀。
3、按分離特征可分：高選擇性毛細管柱分配色譜儀、高靈敏度毛細管柱分配色譜儀和高分辨率毛細管柱分配色譜儀。
4、按流動相物理狀態可分：氣相毛細管柱分配色譜儀和液相毛細管柱分配色譜儀。
5、按分離規模可分：微型毛細管柱分配色譜儀、小型毛細管柱分配色譜儀和大型毛細管柱分配色譜儀。
6、按檢測器的屬性可分：質量型檢測器毛細管柱分配色譜儀和濃度型檢測器毛細管柱分配色譜儀。
7、按用途可分：生物色譜儀、制藥色譜儀、化工色譜儀、食品色譜儀、蛋白質色譜儀、多肽色譜儀、氨基酸色譜儀、糖類色譜儀、酶色譜儀和核酸色譜儀等。
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