當發現氣相色譜儀基線扭曲時，請先檢查電網電源是否有異常波動或突變，特別是大功率設備與電網同一電源連接時，請先檢查。同時檢查儀器的接地是否正確、良好。
基線扭轉。
1.是指基線上下晃動不斷超出標準范圍，不能筆直穩定。
注意：當發現基線扭曲時，請檢查電網電源是否有異常波動或突變，特別是將大功率設備連接到同一電網電源上時，更要注意。同時檢查儀器的接地是否正確、良好。
2.如果熄火后基線仍有扭曲現象。
1）檢查檢測器的溫度是否正常，必要時將檢測器老化。
2）檢查檢測器是否被污染。如有污染，請清洗。
3）檢查離子信號線是否有故障，放大器電路板是否有故障，輸出信號線是否有故障，積分器/工作站是否有故障。
3.火焰熄滅后，基線停止扭動，降低色譜柱箱溫度，扭動幅度不小。
1）檢查空壓機的啟動是否與基線扭轉有關，否則維修空壓機。
2）檢查使用的空氣是否有污染，注意更換氣體過濾器的濾芯，并將空壓機放空。
3）檢查檢測器的溫度是否正常，必要時將檢測器老化。
4）檢查檢測器是否被污染。如有污染，請清洗。
基線漂移過大。
儀器啟動后不久，更換色譜柱，基線漂移正常。基線漂移過大是指基線漂移比正常標準高出很多，不能一直穩定。
1.如果熄滅火焰后基線仍有很大的漂移，要考慮是否是電路系統故障或接觸不良、絕緣性能下降等因素。
1）檢查檢測器是否被污染，如被污染，請清洗。
2）檢查檢測器與離子信號線是否接觸不良、絕緣退化等因素。使用TCD時，請檢查TCD的鎢絲和引線是否接觸不良。
3）檢查離子信號線是否有故障，放大器電路板是否有故障，輸出信號線是否有故障，積分器/工作站是否有故障。
4）檢查氣相色譜儀的溫度是否正常，必要時對檢測器進行老化。
2.火焰熄滅后，基線不再漂移，色譜柱箱的溫度漂移不減。這種情況屬于色譜柱后的問題。
1）首先檢查檢測器是否被污染，如果被污染，請清洗。
2）然后檢查各種氣體是否被污染或流速不正常。
3）檢查檢測器的溫度是否有波動。
4）當檢測器的工作溫度高于350℃時，毛細管柱外側的一些樹脂成分可能會受熱分解造成基線漂移。在這種情況下，請將FID溫度降低到350℃以下。
5)使用TCD時，請檢查TCD鎢絲電流設置是否過大。
在氣相色譜儀的單一火焰中，雖然碳氫化合物本身的信號很小，但如果它與硫化物同時進入火焰，就會大大降低硫化物的響應，甚至沒有響應。這種現象稱為淬火效應。
