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液相色譜柱
液相色譜儀由高壓液體泵分離系統、檢測器及液相色譜柱（含柱溫控制系統）等三部分組成。其中液相色譜柱是液相色譜工作的關鍵，液相色譜柱的性能直接關系到分離分析的準確性與適用性。
液相色譜柱的分類方法很多，可按鍵合相類型、用途（分析型與制備型）、基質種類等進行分類。
例如：
A:物理因素
1.硅膠純度 ----- 填料硅膠的純度與殘留金屬離子濃度
2.色譜柱尺寸---填料床的長度和內徑
3.顆粒形狀------球型或不規則型
4. 粒徑-----------平均顆粒直徑，通常3-10μm
5.表面積---------顆粒外表面和內孔表面的總和，以m2/gram表示
6.孔徑------------顆粒的孔或腔的平均尺寸，范圍80-300Å;
B：化學性質
1.鍵合類型----- 單體鍵合 - 鍵合相分子與基體單點相連
2.碳覆蓋率------與基體物質相連的鍵合相的量
3.封端------------鍵合步驟之后， 用短鏈將的硅羥基鍵合后封閉起來
影響因素
1 、硅膠基質柱（4大類）
目前，分析型液相色譜柱多為硅膠基質柱，細分為：
高純硅膠柱：以硅烷化硅膠（Silica）為填料，應用范圍較廣，但只能在PH2.0-7.5，小于60度的條件下使用。又由于強極性硅羥基（Si-OH)的次級保留效應較強，所以應用受到局限，已被鍵合相柱所取代。
反相硅膠柱：是以硅烷化硅膠為基質，表面鍵合弱極性官能團的固定相。目前多用C18（ODS）、C8（MOS）、C6H5（phenyl，苯基）等。用于分離大多數有機化合物，應用范圍比較寬。
正相硅膠柱：是以硅烷化硅膠為基質，表面鍵合極性官能團的固定相。目前較多的為：NH2—（氨基）、CN—（氰基）、DIOL（二羥基，也常做HILIC單獨分類列出，多用于分離有機酸、蛋白質等）。多用于分離光學異構體和反相柱子不能分離的極性比較大的物質。
離子交換柱：是以硅烷化硅膠為基質，以磺化交聯鍵合強陽/陰離子基團（磺酸鹽/季銨堿）的固定相，又分為強酸性、強堿性、弱酸性、弱堿性等不同規格。用于分離解離性較強的有機鹽類化合物。（注意：不要同離子色譜混淆，離子色譜主要是分離無機鹽類化合物或某些帶點離子。）
2、聚合物基質柱
聚合物基質柱是指采用聚苯乙烯—二乙烯基苯、聚甲基丙烯酸脂、多孔性微球蛋白等聚合物凝膠作為主要填料的一類色譜柱。其相對于硅膠柱具有強的疏水性及寬泛的pH范圍（1.0～14.0），但柱效較低，目前主要應用于凝膠滲透色譜（GPC）、凝膠過濾色譜（GFC）及分子排阻色譜（MEC）。主要用于分離蛋白質類等大分子化合物。
3、其他無機物填料柱
這類色譜柱只于特用途，主要有石墨化碳、氧化鋁（Al2O3）、氧化鋯（ZrO2）等填料。不需要進行表面改性，其自身表面對多類化合物有強保留。可在任意pH（氧化鋁除外，不能大于12.0）及高溫度（可達100℃）下使用。其中，石墨化碳填料柱能分離多種化合物，主要用于分離幾何異構體；氧化鋁柱剛，柱床穩定，可分離多種化合物且多用于制備色譜；氧化鋯柱較氧化鋁柱有強的pH適用范圍及能耐受高的溫度，但其應用尚待進一步研究。
在選擇色譜柱之前，先多了解自己的樣品和雜質，他們的類型結構、極性、酸堿性、分子量大小等等。
1.樣品是極性的且弱酸性的；就可以選擇C18在100酸性水溶液條件下檢測，即要選擇承受100純水且對極性化合物保留好的色譜柱
2. 如果樣品極性太強，或酸性太強；可以選擇CN，NH2，或硅膠柱，HILIC（親水色譜），也有使用C18+強陰離子對試劑或強陰離子交換色譜柱（缺點是離子對試劑平衡時間長，對流動相pH要求比較精密，否 則很難重復實驗，另外離子對試劑很難洗下來，基本上用了離子對的色譜柱就不用于其它實驗）
3. 若樣品是堿性的；可選擇高純硅膠柱（高純硅膠缺少金屬雜質，且硅膠端基封尾）或一些經過修飾的C18柱（如極性嵌入技術或堿去活技術等），他們都會減少堿性化合物的拖尾，一般會選擇中性或偏堿的條件下做，因為這樣可增加堿性樣品的保留
4.如果堿性化合物的極性太強，或堿性太強；可以選擇寬pH的C18色譜柱在高pH值檢測（優點是方法開發簡單，缺點是目前實現這一技術的色譜柱品牌比較少，價格也高）或者選用HILIC色譜柱（硅膠柱在反相條件下使用，這也是很經典的檢測堿性樣品的方法）選擇強離子交換柱（缺點 是不能用來分析其它樣品，對流動相pH要求比較精密，否則很難重復實驗）也有使用C18+強陰離子對試劑或強陰離子交換色譜柱