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上海徠同生物科技有限公司

NuSmart®在FFPE(福爾馬林固定石蠟包埋)鑒定中應(yīng)用

時(shí)間:2024-9-4閱讀:191
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NuSmart®FFPE(福爾馬林固定石蠟包埋)鑒定中應(yīng)用

——無(wú)需脫蠟、一片即結(jié)果

 

FFPE是"福爾馬林固定、石蠟包埋"(Formalin-Fixed and Paraffin-Embedded)的縮寫(xiě),是一種常見(jiàn)的組織樣本保存方法。在醫(yī)學(xué)研究和臨床診斷中,F(xiàn)FPE可用于組織學(xué)檢查、病理診斷和分子分析。而FFPE在分子分析中的應(yīng)用主要包括:

1、癌癥研究FFPE樣本常用于癌癥基因組學(xué)研究,包括突變分析、拷貝數(shù)變異檢測(cè)等。

2、基因表達(dá)分析:FFPE樣本中的RNA可用于基因表達(dá)分析,了解疾病相關(guān)基因的表達(dá)模式。

3、DNA甲基化分析:FFPE樣本可用于研究DNA甲基化狀態(tài),探索與疾病相關(guān)的表觀遺傳學(xué)改變。

4、miRNA分析:FFPE樣本中的miRNA可用于研究其在疾病發(fā)生發(fā)展中的作用。

5、生物銀行和歷史樣本研究:利用存儲(chǔ)的歷史FFPE樣本進(jìn)行生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)和驗(yàn)證研究。

愿望是美好的,現(xiàn)實(shí)是提取FFPE中DNA存在很多“痛處",例如

1、DNA損傷和化學(xué)修飾:福爾馬林固定導(dǎo)致DNA發(fā)生化學(xué)修飾,如堿基脫嘌呤、鏈間交聯(lián)等。

2、DNA片段化:FFPE樣本中的DNA通常已部分降解,形成較小的片段,這可能影響某些需要較長(zhǎng)DNA片段的實(shí)驗(yàn)。

3、DNA與蛋白質(zhì)的交聯(lián):DNA可能與組蛋白等蛋白質(zhì)緊密交聯(lián),增加了提取和純化的難度。

4、樣品質(zhì)量控制:組織脫水、固定延遲或時(shí)間過(guò)長(zhǎng)等因素都會(huì)損害標(biāo)本質(zhì)量。

5、DNA提取效率:目前市場(chǎng)的FFPE提取試劑盒性能差異很大,提取時(shí)間和提取效率都有很大不同。

6、PCR抑制劑:FFPE樣本中可能存在PCR抑制劑,影響后續(xù)的PCR擴(kuò)增反應(yīng)。

NuSmart®技術(shù)wan美解決以上痛點(diǎn),NuSmart®FFPE樣本PCR試劑盒提供了FFPE Buffer用于將切片中組織DNA釋放出來(lái),高耐受力的2× FFPE Smart Mix能夠抑制常見(jiàn)干擾劑。總結(jié)來(lái)看有以下特點(diǎn):

—1-2片切片就有結(jié)果

—操作簡(jiǎn)單,無(wú)需脫蠟

—操作便捷,僅需要10分鐘

—僅需要加熱處理

—無(wú)需配備昂貴設(shè)備

 

操作流程

圖片1.png

 

 

 

案例 不同組織切片擴(kuò)增8對(duì)引物

圖片2.png

 

1、肝 2、肺 3、胃

 

使用NuSmart®FFPE樣本PCR試劑盒(貨號(hào)Nu-FFPE0101)處理肝、肺、胃三組切片,使用2× FFPE Smart Mix擴(kuò)8對(duì)引物

 

 

 

 

 

 


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