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臨床檢測(cè)中ctDNA的意義,德國(guó)MB核酸污染祛除助力科研

閱讀:802      發(fā)布時(shí)間:2023-8-3
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隨著核酸檢測(cè)技術(shù)的發(fā)展,疾病檢測(cè)技術(shù)也得以發(fā)展。核酸實(shí)驗(yàn)中即使只有一個(gè)污染的DNA分子被檢測(cè)到,也會(huì)使整個(gè)PCR檢測(cè)過程出現(xiàn)誤差。為確保PCR試驗(yàn)數(shù)據(jù)準(zhǔn)確,預(yù)防DNARNA交叉污染,PCR實(shí)驗(yàn)室大多會(huì)常備DNA/RNA污染清除劑。PCR Clean可有效地降解大多數(shù)表面上(輕質(zhì)金屬或有色金屬除外)的擴(kuò)增子,質(zhì)粒或基因組DNARNA。該產(chǎn)品還能有效地去除DNA酶和RNA酶。

 

在過去的20年里,癌癥存活率一直在不斷提高,這在很大程度上歸功于更有效的治療和改進(jìn)的患者管理策略。細(xì)化識(shí)別患者誰可能受益于輔助治療后明確的管理是優(yōu)化患者護(hù)理的關(guān)鍵。由于適當(dāng)?shù)母深A(yù)可以改善預(yù)后,明智地使用額外的治療可以使復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)低的患者免受不良治療效果和不必要的費(fèi)用。

 

目前的疾病管理模式以腫瘤特異性、分期為基礎(chǔ)的建議為中心,主要依靠病理和影像學(xué)結(jié)果來優(yōu)化患者的治療計(jì)劃。雖然影像學(xué)是監(jiān)測(cè)疾病進(jìn)展或復(fù)發(fā)以及衡量治療反應(yīng)的標(biāo)準(zhǔn)方法,但放射學(xué)結(jié)果有時(shí)難以正確解釋,導(dǎo)致假陽性和陰性的高發(fā)生率。基于血液的代謝腫瘤標(biāo)志物(如癌胚抗原(CEA)、癌抗原(CA)-125CA19-9和乳酸脫氫酶(LDH))是評(píng)估疾病狀態(tài)的一種非侵入性方法。然而,許多這些已建立的生物標(biāo)志物被認(rèn)為是不可靠的,因?yàn)樗鼈兛赡苡捎谂c癌癥無關(guān)的疾病而升高,導(dǎo)致低靈敏度和特異性。

 

ctDNA已經(jīng)成為一種非侵入性的、基于血液的生物標(biāo)志物,廣泛反映了腫瘤組織中發(fā)現(xiàn)的體細(xì)胞變異。已經(jīng)開發(fā)了幾種測(cè)量ctDNA的方法,例如基于小組的測(cè)定,下一代測(cè)序和液滴數(shù)字聚合酶鏈反應(yīng),并在其他地方進(jìn)行了深入討論。除了每種腫瘤類型固有的生物學(xué)差異之外,每種檢測(cè)的潛在ctDNA檢測(cè)方法和分析驗(yàn)證措施(如敏感性和特異性)的差異也會(huì)影響對(duì)結(jié)果的后續(xù)解釋。無論采用何種檢測(cè)方法,在臨床解釋ctDNA結(jié)果時(shí),也應(yīng)考慮通過變異等位基因分?jǐn)?shù)(作為百分比)或腫瘤分?jǐn)?shù)(作為每毫升腫瘤分子的平均數(shù)量)來定量測(cè)量循環(huán)腫瘤負(fù)荷。ctDNA有多種應(yīng)用,包括早期癌癥檢測(cè)、用于治療選擇的綜合基因組分析、分子殘留病(MRD)檢測(cè)、復(fù)發(fā)監(jiān)測(cè)和治療反應(yīng)監(jiān)測(cè)。這些臨床應(yīng)用的適當(dāng)測(cè)定可能會(huì)有所不同,這取決于在特定的臨床場(chǎng)景中必須評(píng)估什么。

 

臨床研究已經(jīng)證實(shí)ctDNA檢測(cè)及其濃度與腫瘤負(fù)荷、治療反應(yīng)和預(yù)后之間存在關(guān)聯(lián)。使用不同分析技術(shù)的大量研究表明,ctDNA是一種敏感和特異性的MRD檢測(cè)生物標(biāo)志物。它可能比放射成像和其他標(biāo)準(zhǔn)護(hù)理(SOC)方法早幾個(gè)月,但最好與標(biāo)準(zhǔn)監(jiān)測(cè)診斷結(jié)合使用。然而,目前對(duì)ctDNA臨床應(yīng)用的了解僅限于主要是觀察性或軼事性質(zhì)的研究,并且僅限于特定適應(yīng)癥。有必要檢查基于ctdnaMRD檢測(cè)在跨適應(yīng)癥的介入性試驗(yàn)中的臨床應(yīng)用。目前這類臨床試驗(yàn)的研究結(jié)果已經(jīng)在之前的文獻(xiàn)中進(jìn)行了回顧。最后,目前只有少數(shù)基于ctdnaMRD檢測(cè)方法可供臨床醫(yī)生商業(yè)化使用,每種方法都具有不同程度的預(yù)測(cè)和預(yù)后價(jià)值。因此,盡管ctDNA在癌癥患者中的應(yīng)用的現(xiàn)有數(shù)據(jù)很有希望,但至關(guān)重要的是,訂購(gòu)提供者了解這種新型生物標(biāo)志物的含義、優(yōu)勢(shì)和局限性,以便將結(jié)果最佳地應(yīng)用于臨床實(shí)踐。

 

研究人員對(duì)ctDNA進(jìn)行優(yōu)化,用于實(shí)體腫瘤MRD檢測(cè)。研究人員還強(qiáng)調(diào)了ctDNA如何幫助指導(dǎo)癌癥患者在其疾病過程中的臨床管理。

 

相關(guān)研究發(fā)表在《Nature》上,文章標(biāo)題為:“Practical recommendations for using ctDNA in clinical decision making"。

 

ctDNA檢測(cè)在血液學(xué)惡性腫瘤中的應(yīng)用和效用先前已經(jīng)討論過。早期癌癥檢測(cè)的篩查方法也會(huì)檢查游離DNA (cfDNA),盡管也會(huì)分析其他特征(例如甲基化)。初步數(shù)據(jù)表明這種篩檢的臨床效用,但它們不是用于監(jiān)測(cè)疾病進(jìn)展的,因此不包括在本討論中。本篇研究中,研究人員首先討論在手術(shù)或最終治療之前和之后ctDNA結(jié)果的解釋。然后研究人員討論了當(dāng)ctDNA檢測(cè)用于MRD時(shí)的技術(shù)考慮。科研人員對(duì)完成SOC治療后ctdna陽性和陰性患者的處理提出建議。最后,本篇文章討論了ctDNA檢測(cè)在新輔助治療中治療反應(yīng)監(jiān)測(cè)的應(yīng)用,特別是在免疫治療的背景下。在所有情況下,評(píng)估ctDNA的結(jié)果都應(yīng)該在對(duì)患者進(jìn)行更大范圍的綜合評(píng)估的背景下進(jìn)行,從而完善標(biāo)準(zhǔn)的臨床分期和風(fēng)險(xiǎn)分層。


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