尼康E100采用了尼康*的CFI無限遠光學系統，并對色差和場曲進行校正，工作距離更長，數值孔徑更高。同時全新的LED照明提供長壽命自然的光源。新的BE平場消色差系列物鏡專為E100設計，確保在各個放大倍數下得到清晰明亮的圖像。是一款具有光學性能，合理人機學設計的正置顯微鏡,是教學和實驗應用的理想顯微鏡。
尼康研發的新型CFI BE平場物鏡的特點是對整個視場的場曲和色差進行特殊校正，于E100。在所有放大倍數下都可以得到清晰明亮的圖像。E100采用Siedentopf型目鏡筒，保證精確的目鏡筒長度。有雙目和三目兩種型號。數碼相機可以聯機在三目鏡筒上使用。聚光器上帶有孔徑光闌和4x、10x、40x、60x、100x物鏡的位置指示標簽，確保簡單快速地切換物鏡得到完美的圖像。
尼康E100同軸粗/微調旋鈕位于桌平面高度，調焦旋鈕和載物臺手柄采用人機學設計，與操作者的距離相同，可以在正常坐姿下輕松進行調節。另外粗調的扭矩也可以調節。
尼康E200還擁有防霉設計，在物鏡、目鏡和目鏡筒中使用防霉涂層和防霉條，避免在高濕度的環境中使用產生霉變。顯微鏡機身設計緊湊，重量很輕，只需一個儲存箱就可以輕松實現E100的運輸和保管。
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