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Nat Genet:科學(xué)家發(fā)現(xiàn)了一種能測定細(xì)胞年齡的新方法
日前,一項刊登在雜志Nature Genetics上的研究報告中,來自美國文安德爾研究所(Van Andel Research Institute,VARI)等機構(gòu)的研究人員通過研究開發(fā)了一種簡單直接的計算方法來測定細(xì)胞的年齡,這一壯舉性研究或能幫助研究人員針對癌癥和其它人類疾病開發(fā)出更加有效簡單的篩查和監(jiān)測方法。
圖片來源:medicalxpress.com
研究人員表示,我們利用了一種漸進(jìn)的能夠測量損失的特殊化學(xué)標(biāo)記進(jìn)行研究,這種標(biāo)記能夠調(diào)節(jié)基因的活性,同時在機體發(fā)育zui早期階段能夠被檢測到,這些變化能夠貫穿個體的一生,其與機體細(xì)胞相關(guān)而不是機體的實際年齡,能夠有效預(yù)測癌細(xì)胞的變化情況。這項研究基于2011年研究人員的發(fā)現(xiàn),此前研究者Berman及同事在癌癥基因組的特殊區(qū)域中發(fā)現(xiàn)甲基化基團(DNA標(biāo)記)的缺失,然而,此前研究者所使用的技術(shù)無法檢測到正常細(xì)胞中所發(fā)生的變化。
研究人員Laird說道,當(dāng)細(xì)胞開始分裂時,細(xì)胞的細(xì)胞時鐘就開始計時了,我們所開發(fā)的新方法能夠幫助我們追蹤細(xì)胞過去分裂的歷史,同時測定年齡相關(guān)的遺傳代碼的改變情況,這些改變或能促進(jìn)機體正常的老齡化和異常狀況。人類機體中含有近乎40萬億個細(xì)胞,每個細(xì)胞都能夠被追溯到其含有單一DNA拷貝的單一受精卵細(xì)胞,在人的一生中,這些細(xì)胞會不斷分裂,在不同階段,根據(jù)機體不同的因素移除損傷或衰老的細(xì)胞,比如在環(huán)境刺激下或傷口愈合時。
盡管機體已經(jīng)進(jìn)行了詳細(xì)的生物質(zhì)量控制檢查,但每個細(xì)胞分類都會破壞基因組的完整性,從而留下一些不斷積累的變化,其中zui為主要的就是基因組中甲基化基團數(shù)量和位置會發(fā)生巨大變化,而這也是胚胎開始發(fā)育時所出現(xiàn)的過程,同時該過程還會貫穿機體整個生命周期。研究者Berman說道,我們所采用的新技術(shù)能夠?qū)⑦@一過程推動到胚胎在子宮發(fā)育的早期階段,這讓人覺得非常奇妙,考慮到目前研究者的假設(shè),似乎在通往癌癥的道路上,這一過程的進(jìn)程相對較晚一些,同時其在腫瘤形成的早期階段也扮演著至關(guān)重要的作用。
當(dāng)甲基化基團缺失,即出現(xiàn)低甲基化,就形成了很多癌癥zui常見的特征,然而目前研究人員并不清楚其背后所涉及的分子機制,然而在較高更新率的組織中出現(xiàn)癌癥似乎更為嚴(yán)重一些,比如皮膚和上皮組織,這種現(xiàn)象在兒童癌癥中表現(xiàn)也尤為突出,比如兒童的髓母細(xì)胞瘤。研究者Shen說道,較高更新率的組織通常而言都非常容易患上癌癥,因為這些組織中會積累很多錯誤,同時也會驅(qū)動正常細(xì)胞轉(zhuǎn)化成為癌變細(xì)胞,而一旦細(xì)胞發(fā)生癌變的話,正常的細(xì)胞衰老過程就會增強并加速這一效應(yīng),累積效應(yīng)似乎是一列失控的“貨運列車”。
研究者Wanding Zhou表示,這項研究涵蓋了39種不同的腫瘤、超過340個人類和200個小鼠的數(shù)據(jù)庫,我們對其進(jìn)行了深度的分析,如果沒有來自大規(guī)模測序研究(包括癌癥基因組圖譜)計劃所公開的數(shù)據(jù)研究人員或許無法進(jìn)行相應(yīng)的深入分析,而本文研究恰恰就是一個很好的例子,由于研究人員能夠獲取更為廣泛的數(shù)據(jù),如今他們就能看到這些數(shù)據(jù)的確能夠有效推動他們在各領(lǐng)域的研究進(jìn)展了。(生物谷Bioon.com)
原始出處:
Wanding Zhou, Huy Q. Dinh, Zachary Ramjan,et al. DNA methylation loss in late-replicating domains is linked to mitotic cell division. Nature Genetics (2018) doi:10.1038/s41588-018-0073-4