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科學(xué)家發(fā)現(xiàn)預(yù)測疾病的重要線索！基因型預(yù)測表型可沒你想的那么簡單！
你掌握的信息越多，你就越可能更好地預(yù)測接下來會發(fā)生什么。臨床醫(yī)生和衛(wèi)生研究人員也常在尋找基因突變以預(yù)測胎兒是否有出生缺陷的風(fēng)險，或者一個人是否有患某種疾病的風(fēng)險，但是這些預(yù)測通常都不準(zhǔn)確。來自卡爾加里大學(xué)的研究人員現(xiàn)在發(fā)現(xiàn)了一種重要的因素，改變了我們對基因突變（基因型）與它們在人身上的表現(xiàn)（表型）之間關(guān)系的認(rèn)知，這也許會在將來某一天幫著我們提高預(yù)測的準(zhǔn)確率。
圖片來源：Cumming醫(yī)學(xué)院
“這項(xiàng)工作的意義就是它幫助我們明白為什么同樣攜帶一個基因突變，有些人患病而有些人卻很健康。”研究*作者、Benedikt Hallgrimsson實(shí)驗(yàn)室的博士后研究員Rebecca Green說道。“這在唇腭裂中很常見，兩個攜帶相同基因突變的孩子，可能一個患唇腭裂，而另一個不會。”
為了更深入探索原因，研究人員在基因表達(dá)水平進(jìn)行了研究。長期以來人們都認(rèn)為基因表達(dá)改變會導(dǎo)致這些基因決定的特征改變。很多特征的改變（如面部形狀、身高或者血壓）都是基因表達(dá)水平的差異決定。
通過使用小鼠胚胎，他們創(chuàng)造了一系列基因突變，可以逐漸降低一個叫做Fgf8的基因的表達(dá)水平，而這個基因?qū)γ娌空０l(fā)育至關(guān)重要。他們使這個基因的表達(dá)水平從100%逐漸降低到20%。然后他們記錄了基因表達(dá)水平的改變和面部的改變程度之間的關(guān)系，結(jié)果發(fā)現(xiàn)這種關(guān)系既不是成比例的，也不是常數(shù)，而是非線性的。
“我們的結(jié)果顯示就算這個基因表達(dá)水平降低50%，你的臉都是*正常的。，但是進(jìn)一步降低的話，也并不意味著缺陷增加——你可能有多種結(jié)果：從*典型的臉到幾乎沒有臉。” Cumming醫(yī)學(xué)院細(xì)胞生物學(xué)和解剖學(xué)系主任 Hallgrimsson博士說道。“這些效應(yīng)導(dǎo)致了基因型和表型之間非線性的變化。如果你不知道這種關(guān)系，你就無法根據(jù)基因型預(yù)測表型。”
這些研究結(jié)果發(fā)表在《Nature Communications》上。
“這是從基因型預(yù)測疾病很關(guān)鍵的一點(diǎn)。” Hallgrimsson博士說道。“它增進(jìn)了我們對基因如何與每個人相互作用的了解，也告訴了我們可能產(chǎn)生多么具有差異性的結(jié)果。”
Hallgrimsson推測如果研究人員探索大多數(shù)真正重要的基因，可能他們也會發(fā)現(xiàn)相似的結(jié)果。
“從基因型預(yù)測表型的科學(xué)并沒有人們認(rèn)為的那么先進(jìn)。” Hallgrimsson博士說道。“我們正在使用的預(yù)測工具需要把非線性性考慮進(jìn)去，以修正并提高使用基因組學(xué)信息預(yù)測表型的算法。這種優(yōu)化對預(yù)測疾病風(fēng)險至關(guān)重要。”
這項(xiàng)工作對進(jìn)化生物學(xué)也有重要意義。所有的生物體都攜帶相同數(shù)量的基因突變。一個物種為了生存，它必須要能夠耐受一定的基因突變并成功發(fā)育繁殖。這項(xiàng)研究表明發(fā)育中的非線性性是這種現(xiàn)象的主要原因。（生物谷）
參考資料：
Rebecca M. Green et al. Developmental nonlinearity drives phenotypic robustness, Nature Communications (2017). DOI: 10.1038/s41467-017-02037-7