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02

2013年
08月

DNA實(shí)驗(yàn)技術(shù):區(qū)域特異性誘變實(shí)驗(yàn)

標(biāo)簽:區(qū)域特異性誘變可在長(zhǎng)達(dá)3‘的克隆化DN段上產(chǎn)生大量的隨機(jī)分布的核苷酸替換突變,在將DNA克隆到一個(gè)可用來(lái)分離單鏈DNA的載體后,用各種可造成特定堿基損傷的化學(xué)試劑處理。實(shí)驗(yàn)方法基本方案實(shí)驗(yàn)材料DNA試劑、試劑盒乙酸鈉亞硝酸鈉TE無(wú)水乙醇dNTP反轉(zhuǎn)錄酶RNA酶洗脫液溴化乙錠儀器、耗材水浴鍋培養(yǎng)箱實(shí)驗(yàn)步驟1.用限制性?xún)?nèi)切核酸酶消化DNA以獲得目的DN段,將靶片段雙向克隆到M13噬菌體載體或含有M13復(fù)制起始子的質(zhì)粒載體中。從100ml感染細(xì)抱培養(yǎng)物中提取單鏈DNA。2.在三個(gè)微量離心管內(nèi)各加
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02

2013年
08月

DNA實(shí)驗(yàn)技術(shù):SNP實(shí)驗(yàn)標(biāo)準(zhǔn)操作規(guī)程

一、原理SNP(SingleNucleotidePolymorphism)即單核苷酸多態(tài)性,是由于單個(gè)核苷酸改變而導(dǎo)致的核酸序列多態(tài)性(Polymorphism)。據(jù)估計(jì),在人類(lèi)基因組中,大約每千個(gè)堿基中有一個(gè)SNP,無(wú)論是比較于限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(RFLP)分析還是微衛(wèi)星標(biāo)記(STR),都要廣泛得多。SNP是我們考察遺傳變異的zui小單位,據(jù)估計(jì),人類(lèi)的所有群體中大約存在一千萬(wàn)個(gè)SNP位點(diǎn)。一般認(rèn)為,相鄰的SNPs傾向于一起遺傳給后代。于是,我們把位于染色體上某一區(qū)域的一組相關(guān)聯(lián)的SNP等位
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02

2013年
08月

DNA實(shí)驗(yàn)技術(shù):甲醛變性電泳檢測(cè)RNA完整性

一、材料、試劑和儀器1、材料:植物總RNA5-10μg2、試劑:1)加樣運(yùn)載緩沖液(Loadingbuffer)50%甘油1mmol/LEDTA(pH8.0)0.25%溴酚藍(lán)25%二甲苯氰FF2)10×TAEBuffer3)5×甲醛凝膠電泳緩沖液:0.1mol/LMOPs(pH7.0)40mmol/L乙酸鈉5mmol/LDETA(pH8.0)4)甲醛,甲酰胺3、儀器:電泳裝置,紫外透射觀(guān)測(cè)儀二、實(shí)驗(yàn)程序1、甲醛變性的瓊脂糖(Agarose)凝膠的配制在250mL的錐形瓶中準(zhǔn)確稱(chēng)量2gAgaros
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27

2013年
07月

DNA實(shí)驗(yàn)技術(shù):多藥抗藥基因的表達(dá)實(shí)驗(yàn)

多藥抗藥基因的表達(dá)實(shí)驗(yàn)標(biāo)簽:抗藥基因多藥抗藥基因的表達(dá)實(shí)驗(yàn)是通過(guò)反轉(zhuǎn)錄和PCR的方法來(lái)檢測(cè)特定基因的過(guò)度表達(dá)。實(shí)驗(yàn)方法PCR擴(kuò)增法實(shí)驗(yàn)方法原理大多MDR細(xì)胞膜上出現(xiàn)MDR-1基因及其基因產(chǎn)物P-糖蛋白過(guò)度表達(dá)。實(shí)驗(yàn)材料RNA試劑、試劑盒PBS氯仿異丙醇萘酸異硫氰酸肽十二烷基肌酸鈉構(gòu)櫞酸鈉乙酸鈉二疏基乙醇乙醇Taq酶儀器、耗材離心機(jī)紫外分光光度計(jì)瓊脂糖凝膠電泳PCR儀實(shí)驗(yàn)步驟一、細(xì)胞總RNA提取1.收集約5×107個(gè)細(xì)胞,冷PBS洗滌。2.加入400ulRNA提取液(含6mol/l的異硫氰酸肽,0
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27

2013年
07月

DNA專(zhuān)題:質(zhì)粒DNA提取及瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)

一、堿變性法提取質(zhì)粒DNA質(zhì)粒(Plasmid)是細(xì)菌染色體外能自身獨(dú)立復(fù)制的雙股環(huán)狀DNA。帶有遺傳信息,可賦予細(xì)菌某些新的表型。將質(zhì)粒指紋圖譜分析方法、質(zhì)粒DNA探針技術(shù)及檢測(cè)質(zhì)粒的PCR技術(shù)用于臨床感染性疾病的診斷和流行病學(xué)調(diào)查已成為現(xiàn)實(shí)。質(zhì)粒作為載體在基因工程中起著重要的作用。分離和純化質(zhì)粒DNA的方法很多,但這些方法基本包括三個(gè)步驟:即細(xì)菌的培養(yǎng)和質(zhì)粒DNA的擴(kuò)增,細(xì)菌菌體的裂解;質(zhì)粒DNA的提取與純化。本實(shí)驗(yàn)學(xué)習(xí)用堿變性方法提取質(zhì)粒DNA。原理細(xì)菌培養(yǎng)物加入SDS和NaOH堿性溶液處
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27

2013年
07月

DNA專(zhuān)題:真核細(xì)胞基因組提取

一.實(shí)驗(yàn)?zāi)康募氨尘案叩葎?dòng)物,高等植物的基因組相當(dāng)龐大,如人類(lèi)細(xì)胞基因組由30億個(gè)堿基對(duì)組成,果蠅基因組有1.4×108個(gè)堿基對(duì),水稻基因組有1.4×109個(gè)堿基對(duì)。真核細(xì)胞基因組中,約1萬(wàn)-1.5萬(wàn)個(gè)可表達(dá)的結(jié)構(gòu)基因,其它大量存在的是調(diào)控序列和內(nèi)含子序列。可以說(shuō)某特定物種的基因組,包含了該物種生長(zhǎng),發(fā)育,繁殖等各項(xiàng)生理活動(dòng)的幾乎全部信息量,因而對(duì)真核細(xì)胞基因組的結(jié)構(gòu),組成,以及表達(dá)調(diào)控的研究是至關(guān)重要的,而研究的起點(diǎn)就是要獲得純度高--不含蛋白質(zhì)、糖類(lèi)、酚、氯仿等污染;得率好--以便有足夠量用于
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22

2013年
07月

DNA專(zhuān)題:DNA定點(diǎn)突變實(shí)驗(yàn)

本文先講zui簡(jiǎn)單的一個(gè)點(diǎn)的定點(diǎn)突變技術(shù),其它較長(zhǎng)片段的突變,刪除,插入技術(shù)以后會(huì)慢慢奉上:在做實(shí)驗(yàn)之前,我們首先要搞清楚實(shí)驗(yàn)的目的和實(shí)驗(yàn)的原理。實(shí)驗(yàn)的目的應(yīng)該比較明確吧:就是要把自己的基因上面的一個(gè)堿基換成另外一個(gè)堿基。一般情況下我們會(huì)有幾種可能使我們需要這樣去做:*我們吊出來(lái)的基因有點(diǎn)突變,相信這可能是大家經(jīng)常會(huì)遇到的問(wèn)題。基因好不容易吊出來(lái),并裝進(jìn)了自己的載體,卻發(fā)現(xiàn)有一兩個(gè)堿基跟自己的預(yù)期序列或所有的公共數(shù)據(jù)庫(kù)不匹配,然后暴昏。大家實(shí)驗(yàn)室里面還是用Taq酶為主吧,Pfu這樣的高保真酶大家
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22

2013年
07月

DNA專(zhuān)題:血基因組DNA提取實(shí)驗(yàn)

血基因組DNA提取可以:(1)從凍全血、血漿、血清、骨髓、其他體液、淋巴細(xì)胞、培養(yǎng)細(xì)胞、病毒和線(xiàn)粒體中提取DNA;(2)用于后續(xù)測(cè)序、遺傳信息學(xué)等研究。實(shí)驗(yàn)方法血基因組DNA試劑盒提取法血基因組DNA大量試劑盒提取法血基因組DNA中量試劑盒提取法實(shí)驗(yàn)方法原理本試劑盒采用特殊的細(xì)胞裂解和蛋白去除液(包括蛋白酶K裂解)從抗凝全血中得到基因組DNA。適用于從凍全血、血漿、血清、骨髓、其他體液、淋巴細(xì)胞、培養(yǎng)細(xì)胞、病毒和線(xiàn)粒體中提取DNA。實(shí)驗(yàn)材料抗凝全血試劑、試劑盒血基因組DNA試劑盒儀器、耗材96孔
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