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二級生物安全柜是實驗室生物安全防護的關鍵設備，為確保其正常使用、發揮安全作用，年度維護應得到生物安全柜使用單位與實驗室生物安全行政主管部門的重視,維護過程的生物安全防護也必應得到生物安全行政主管部門、生物安全柜使用單位與維保單位的重視。
（1）維護人員必須具有生物安全防護知識與裝備；
（2）不得打開二級生物安全柜的通風系統；如因故障必須打開生物安全柜，打開之前必須經過甲醛熏蒸消毒，確認已經有效殺滅致病性生物危險因子，并可有效控制濾器所截留的致病微生物溢出、擴散；
（3）從二級生物安全柜拆卸下來的濾器，需經滅菌處理后才能作為普通廢棄物拋棄。
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