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化學蛋白組學檢測技術服務詳情介紹
化學dànbáizhì組學是化學生物學研究的重要手段之一,有別于以往對dànbáizhì進行定性或者定量鑒定的dànbáizhì組學技術,化學dànbáizhì組學旨在通過一系列功能各異的化學探針,結合dànbáizhì組學技術,解決復雜體系如細胞裂解液、活細胞、組織中的dànbáizhì如何與小分子藥物相互作用的問題,目前已被廣泛應用于小分子藥物靶點發(fā)現、藥物先導化合物的篩選等研究中。
化學dànbáizhì組學的一般流程是將親和基質或報告基團的化學探針與dànbáizhì組進行孵育,利用親和純化等方法富集與探針結合的蛋白,再通過質譜等其他輔助技術來分析。常用的基于化學dànbáizhì組學的小分子藥物靶點研究方法有兩種,分別是以活性探針為基礎的dànbáizhì譜分析(Activity-based protein profiling, ABPP)和以化合物為中心的化學dànbáizhì組學(Compound-centric chemical proteomics, CCCP)。
圖1 ABPP和CCCP技術流程
ABPP:ABPP的原理是利用活性藥物分子進行修飾合成探針,這些探針能夠與靶標dànbáizhì結合并影響其活性。ABPP通過合成帶有反應基團和標記物的探針,利用這些探針與dànbáizhì發(fā)生相互作用,從而實現對dànbáizhì功能的研究。ABPP的優(yōu)勢在于它標記的是酶的活性形式,而不是非活性形式,因此特別適用于分析不同細胞類型和組織的酶活性,以及檢測正常狀態(tài)和疾病狀態(tài)之間的差異。此外,還經常用于藥物靶點的篩選。
CCCP:CCCP的原理是將藥物分子進行修飾后引入標簽分子,然后固定到基質上(如瓊脂糖凝珠或其他樹脂),富集可以與藥物分子結合的dànbáizhì,然后通過質譜技術進行鑒定。與ABPP相比,CCCP不需要提供dànbáizhì的活性狀態(tài)的直接信息,并且作為一種更加沒有導向性的方法,CCCP可以鑒定出意料之外的生物分子,包括不具有酶功能的dànbáizhì,故可用于探索wánquán未知的新奇藥物靶點。同時,CCCP具有高通量特性,能夠同時分析多個化合物與細胞提取物或活細胞中的dànbáizhì相互作用。
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