空間蛋白組學-百泰派克生物科技檢測技術服務詳情介紹

空間蛋白組學是一門研究細胞內dànbáizhì的三維空間分布及其與其他分子相互作用的學科。有別于傳統的dànbáizhì組學主要關注dànbáizhì的序列、表達水平和相互作用，空間蛋白組學更關注dànbáizhì在細胞內的空間位置和動態變化，這些三維的信息對于我們理解dànbáizhì的功能和調控機制具有重要意義。

圖1 dànbáizhì序列與空間結構關系

空間蛋白組學技術一般流程是通過高精度激光捕獲顯微切割技術 (LCM) 獲取樣本中感興趣的組織區域或細胞，并通過優化的極微量dànbáizhì組學技術，分析蛋白在不同空間位置的表達特征，從而獲得目標樣本中不同功能區域和不同細胞類型的蛋白表達譜。它的研究方法大致分為兩類：包括基于質譜的空間蛋白組學和基于熒光成像的空間蛋白組學。

基于質譜的空間蛋白組學

基于質譜的空間蛋白組學包括MSI和MIBI：

質譜成像技術（Mass Spectrometry Imaging，MSI）是一種將質譜技術與空間定位結合的高精尖技術，能夠在組織和細胞層面上jīngzhǔn捕捉分子質量及位置信息。在蛋白組學研究中，MSI廣泛應用于分析組織切片中dànbáizhì的空間分布，為疾病機制研究和生物標志物的發現提供了重要線索。這種技術無需特異性標記，樣品前處理步驟簡單，空間分辨率高，并且能發揮質譜的效能，可以對上千種生物分子同時進行原位成像分析。

圖2 IMS的工作流程

多重離子束成像技術（Multiplexed Ion Beam Imaging，MIBI）一種二次離子質譜法（Secondary Ion Mass Spectroscopy，SIMS），其原理是將空間成像方法與質譜聯用，使用金屬同位素元素標記抗體，同時檢測樣品切片上的靶標進行成像，進而分析同一組織中的多種dànbáizhì。與MSI相比，MIBI的靈敏度和分辨率更高，可以jīngquè量化免疫細胞亞群及其在腫瘤內的空間分布，但該技術檢測靶標嚴格限制在100個，且成本造價高、可選擇同位素種類受限。

圖3 MIBI的工作流程

基于熒光成像的空間蛋白組學

基于熒光成像的空間蛋白組學應用zuì多的是 CODEX（CO-Detection by IndEXing），CODEX是一種利用dútè的蛋白熒光標記方法來解析dànbáizhì在組織或細胞中的空間分布和相互作用的技術。其核心原理是將抗體偶聯到特異性寡核苷酸“條碼標簽”（Barcode）上，而不直接使用熒光染料標記，通過與Barcode互補的寡核苷酸序列特異性結合進行熒光成像。這種方法突破了可見光譜熒光成像通道數量的限制，能夠同時檢測和分析多達50種甚至更多的蛋白靶標。此外，該技術還具有通量高、空間分辨率高和應用靈活等優勢，因此被廣泛的應用于腫瘤微環境及腫瘤免疫、藥物研發和療效評估等領域。

圖4 CODEX的工作流程

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