如果反應(yīng)結(jié)束后，水中殘留的Fe^{3+}濃度較高，F(xiàn)e^{3+}會水解生成氫氧化鐵膠體或沉淀，從而使水呈現(xiàn)黃色。
有機物氧化不wan全
- 芬頓反應(yīng)的目的是通過產(chǎn)生羥基自由基（\cdot OH）來氧化降解水中的有機物。

但如果有機物濃度過高、反應(yīng)時間不足、芬頓試劑投加量不夠等，導(dǎo)致有機物不能被wan全氧化，可能會生成一些中間產(chǎn)物，這些中間產(chǎn)物可能具有一定的顏色，使出水呈現(xiàn)黃色。
水質(zhì)本身的特性
- 原水中可能含有一些帶色的物質(zhì)，如天然有機物中的腐殖質(zhì)等，芬頓反應(yīng)對這些物質(zhì)的去除效果有限，或者在反應(yīng)過程中這些物質(zhì)的結(jié)構(gòu)發(fā)生改變，但其顏色并未wan全褪去，從而導(dǎo)致出水仍呈現(xiàn)黃色。
反應(yīng)條件控制不當(dāng)
- 芬頓反應(yīng)需要在一定的pH值范圍內(nèi)進行，通常最佳pH值在2 - 4之間。

如果pH值過高或過低，都會影響反應(yīng)的進行，使反應(yīng)效率降低，導(dǎo)致鐵離子的存在形態(tài)發(fā)生變化，進而使出水顏色變黃。另外，反應(yīng)溫度也會對芬頓反應(yīng)產(chǎn)生影響，溫度過高或過低都可能導(dǎo)致反應(yīng)不wan全，使出水出現(xiàn)黃色。