很多小伙伴合成mRNA需要得到基因的CDS序列,今天我們一起來看下基因的CDS序列是怎么找到的。
1. 打開NCBI網站
2. 點擊下列選項,找到“Gene”
3. 選中“Gene”,在搜索框中輸入基因名稱,下圖以“Human TREM2”為例,點擊“Search”
4. 檢索頁面出現的第一個就是,如下圖:
5. 點擊進去,進入基因詳情頁,可以看到有多個轉錄本,如下圖紅框圈出來的。
6. 點擊“reference sequence details”我們需要看下轉錄本的文獻引用和轉本的長度進行選擇那個使我們所需的轉錄本
7. 看到有2個
8. 點進去看下CDS序列長度,一般是選擇序列最長的,如下圖選擇了“NM_018965.4”
9. 點“CDS”,就會彈出標記棕色的序列,這就是此基因的CDS序列啦
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