一、Zymo甲基化試劑盒核心技術特點
1. 高效亞硫酸鹽轉化
-轉化率>99%:采用優化的亞硫酸鹽處理體系(如EZ DNA Methylation-Gold™),確保未甲基化胞嘧啶全部轉化為尿嘧啶,甲基化位點保留完整。
- 快速處理:全程僅需3小時(Lightning系列)至6小時(Gold系列),比傳統方法縮短50%時間。
2. 廣泛樣本兼容性
- DNA類型:適用于基因組DNA(≥50 pg)、FFPE樣本(需預修復)、cfDNA(≥1 ng)。
- 污染物耐受:可處理含10% SDS或1%血紅蛋白的樣本(需配合Zymo Clean & Concentrator純化)。
3. 高靈敏度與重復性
- 檢測下限:甲基化頻率 0.1%(如用于腫瘤早篩的ctDNA檢測)。
- 批間差異:CV <5%(基于NIST標準品驗證)。
二、Zymo甲基化試劑盒與主流產品線對比
三、Zymo甲基化試劑盒典型應用場景
1. 腫瘤表觀遺傳研究
- 早篩標志物驗證:檢測ctDNA中 SEPT9、SHOX2 等基因甲基化(靈敏度95%)。
- 甲基化分型:基于850K芯片數據構建TCGA樣甲基化亞型(如膠質瘤IDH1突變關聯)。
2. 發育生物學
- 單細胞甲基化分析:配合Zymo PicoMethyl™ 試劑盒,處理單細胞DNA(適用于10-100個細胞)。
3. 植物表觀遺傳學
- 環境脅迫響應:檢測 CpG島 和 CHH位點 甲基化動態(需配合BS-Seq分析)。
四、Zymo甲基化試劑盒操作流程優化建議
1. DNA質量控制
- 使用Nanodrop檢測A260/A280(1.8-2.0),A260/A230 >1.8。
- FFPE樣本需先進行 脫蠟修復(推薦Zymo FFPE DNA Kit)。
2. 轉化條件優化
- 高溫變性步驟:98℃ 8分鐘(Gold系列)→ 95℃ 30秒(Lightning系列)。
- 轉化后純化:使用Zymo-Spin IC Column去除亞硫酸鹽殘留(回收率>90%)。
3. 下游兼容性
- PCR擴增:推薦使用ZymoTaq™ PreMix(抗尿嘧啶干擾,擴增效率提升30%)。
- NGS建庫:配合Methyl-Seq Library Kit(UMI標記,降低擴增偏差)。
五、Zymo甲基化試劑盒與競品性能對比
六、Zymo甲基化試劑盒用戶反饋與解決方案
- 常見問題:
1. 轉化后DNA片段化 → 縮短變性時間至5分鐘,使用低熔點瓊脂糖包埋。
2. PCR擴增失敗 → 增加2-4個熱啟動循環(98℃ 10秒→60℃ 30秒)。
3. 批次間差異 → 使用同一批次轉化柱,避免不同溫度環境操作。
- 技術支持:提供 免費實驗方案優化服務(48小時內響應)。
【總結】
Zymo甲基化試劑盒在轉化效率、速度、小樣本兼容性 方面表現很好,尤其適合腫瘤液體活檢和單細胞表觀遺傳研究。
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