抗體屬于異質(zhì)化產(chǎn)品,不同品牌之間,相同品牌不同產(chǎn)品之間,抗體品質(zhì)差異都較為明顯,沒有統(tǒng)一的衡量標準。Nature多次發(fā)文指出:由于品牌、批次、生產(chǎn)方式、實驗條件等差異,抗體具有嚴重的多態(tài)性,易導致重復(fù)性問題。2012年,來自著名生物醫(yī)藥公司Amgen的科學家Glenn Begley領(lǐng)導了一次關(guān)于可再現(xiàn)性的研究。他們挑選了53份具有“標志性意義”的癌癥前臨床研究論文,試圖重復(fù)出這些研究成果。結(jié)果卻令人大失所望:僅有6份論文(11%)的研究成果被重復(fù)出來。數(shù)據(jù)表明,這些癌癥研究都使用了抗體產(chǎn)品,而抗體的差異性和不可靠性正是導致這些研究成果無法被復(fù)制的主要原因。
鑒于抗體驗證的必要性和迫切性,國際上,很多組織機構(gòu)提出了一些卓有成效的措施以指導抗體驗證,匯總起來主要是以下幾種方案:利用CRISPR或RNAi等技術(shù)敲除或降低目標基因的表達;將免疫捕獲與MS分析相結(jié)合,以確定與純化的抗體直接作用的蛋白質(zhì);發(fā)展結(jié)構(gòu)更明確的重組抗體以取代單克隆抗體和多克隆抗體等。
抗體驗證工作是一項長期而艱巨的任務(wù),需要行業(yè)整體持續(xù)的努力。而具體到每個抗體試劑使用者,當我們在實驗中需要檢測目的蛋白在組織中的表達情況的時候,如何選擇適合我們實驗需要的抗體,并妥善保存使用,是每個科研人員需要細心考慮的。
檢測任何目的靶蛋白的抗體都不止一種,如何篩選出我們需要的抗體,主要有以下幾個步驟:首先我們需要確定抗體名稱,注意中英文名稱和別名、背景信息;其次我們需要分析樣本中目的蛋白的結(jié)構(gòu)性質(zhì),根據(jù)蛋白本身結(jié)構(gòu)域的信息和樣本預(yù)處理過程中發(fā)生的可能變化,判斷所選抗體需識別的表位區(qū)域和被驗證的具體實驗應(yīng)用,如WB、IHC、ICC、ELISA、FCM等;然后還需要分析抗體的種屬反應(yīng)特異性,一般抗體說明書都會列出已經(jīng)驗證過的種屬信息,如可用于rat、mouse、human、pig、goat等;最后,在含有二抗的實驗體系中,一抗種屬來源的選擇,應(yīng)與實驗種屬親緣性越遠越好,以減少同源性造成的交叉反應(yīng)。
除此之外,二抗應(yīng)來源于抗一抗的物種,比如一抗來源于兔,那么二抗就應(yīng)選擇抗兔的。二抗標記方式通常有偶聯(lián)HRP、AP、Biotin、熒光素等,應(yīng)根據(jù)所需開展的實驗選擇合適標記方式的二抗。
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