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黃酮類化合物主要有黃酮糖苷與苷元兩種形式，天然銀杏中95%以上的黃酮是以糖苷形式存大的，研究者大量研究顯示，黃酮苷元和糖苷有不同的生理作用。例如，黃酮苷元清除人體氧自由基的生物活性明顯優于黃酮糖苷。

銀杏葉提取物中的槲皮素葡萄糖苷在水解之后相當于300微摩爾每升的槲皮素，與1毫克每毫升的GBE誘導產生的血管擴張作用相比，300微摩爾每升的槲皮素誘導生產的血管擴張作用更強。糖苷型黃酮類化合物進入消化道后水解成苷元才能被吸收利用，如大豆異黃酮的吸收主要通過兩種途徑，脂溶性的苷元可從小腸直接吸收，而以苷類形式存在的異黃酮不能通過小腸壁，而是通過結腸中細菌的β葡萄糖苷酶而水解，生成的產物又進一步被細胞降解生成苷元。

研究者在研究黃酮在人體中的吸收中指出，小腸是吸收類黃酮配糖基的主要部位，而類黃酮化合物的脫葡萄糖基是吸收代謝的關鍵部位，而類黃酮化合物的脫葡萄糖基是吸收代謝的關鍵一步，而且小腸上皮細胞中的β葡萄糖苷酶的活性是關系黃酮類化合物生物效價的決定因素。