組學(xué)社區(qū)福利！重磅回看- HUPO 2020 賽默飛用戶會
HUPO作為蛋白質(zhì)組學(xué)的盛會，每年都會成為業(yè)內(nèi)關(guān)注的焦點。2020 年受到新冠疫情影響，轉(zhuǎn)戰(zhàn)線上，并新命名Connect。在這場代表蛋白質(zhì)組學(xué)ding尖水平的盛會上，有哪些令人耳目一新的新技術(shù)，又哪些讓人眼前一亮的新應(yīng)用？許多錯過現(xiàn)場精彩內(nèi)容的老師一定有所遺憾。作為組學(xué)社區(qū)的福利之一，我們將為您回放HUPO 2020之中一場看點頗多的賽默飛用戶會：Accelerating COVID-19 Proteomics Research Using Tandem Mass Tags，讓您不再錯失精彩！
看點直擊
看點一：TMT 定量分析
TMT標(biāo)記定量助力新冠研究
TMT標(biāo)記定量方案擁有更優(yōu)的分析速度、覆蓋深度和定量質(zhì)量；并可靈活與SILAC標(biāo)記技術(shù)聯(lián)用，進(jìn)行快速蛋白差異分析。
圖1. 多重增強蛋白質(zhì)動力學(xué)(multiplexed enhanced protein dynamicsme, mePROD)實驗流程（點擊查看大圖）
它的價值在于提升蛋白質(zhì)組的解析深度；一次性在多個樣品中量化蛋白水平的差異，定量準(zhǔn)確性更高；適用于更復(fù)雜的大樣本實驗設(shè)計,有效地縮短了實驗時間,加速確證病毒致病性相關(guān)的生物途徑以及尋找潛在的藥物靶標(biāo)。
看點二：直擊新冠
COVID-19研究熱點話題與成果展示
借助TMT實驗流程，能夠從多角度分析SARS-CoV-2蛋白組學(xué)，進(jìn)而全面了解在新冠發(fā)展進(jìn)程中，SARS-CoV-2病毒的感染機制、宿主細(xì)胞信號通路的改變、輕重癥患者免疫反應(yīng)，以及COVID-19zhi療藥物的潛在靶點。
圖2. SARS-CoV-2引起的免疫相關(guān)蛋白變化（點擊查看大圖）
看點三：多種冠狀病毒的橫向分析
基于親和純化質(zhì)譜技術(shù)（AP-MS）和TMT流程，比較SARS-CoV-1和SARS-CoV-2、MERS-CoV非結(jié)構(gòu)同源蛋白與宿主蛋白的相互作用，量化不同病毒間 Nsp2、Nsp4及Nsp3同源蛋白的差異并進(jìn)行富集分析。
圖3. 病毒-宿主蛋白互做關(guān)系
借助AP-MS的特異性與TMT的高通量優(yōu)勢，可以目標(biāo)性地開展蛋白互作圖譜分析，幫助揭示了SARS-CoV-1、SARS-CoV-2、MERS-CoV之間共享/*的病毒-宿主依賴關(guān)系 ，非結(jié)構(gòu)蛋白驅(qū)動的病毒復(fù)制和致病性，調(diào)節(jié)蛋白穩(wěn)態(tài)用于疾病干預(yù)zhi療。
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