色譜儀的衍生化主要是為了提高目的物的可檢測性。對于液相色譜儀，衍生化主要是為了提高檢測器對目的物的響應。衍生一般分為柱前衍生和柱后衍生，各有其特點。

一、柱前衍生：在經過分析柱前使分析物與衍生劑反應，反應產物在分析柱上實現(xiàn)分離，實際分離的是衍生產物，檢測的也是衍生產物。

1、優(yōu)點：相對自由地選擇反應條件，對設備要求不高；有較多的衍生劑可選擇，可以手工衍生；而且對衍生時間要求相對寬泛，不存在反應動力學的限制，衍生副產物可進行預處理；

2、缺點：形成的衍生副產物可能對色譜分離造成較大困難；在衍生化過程中，容易引入了過多的物質，對柱子有潛在的負面影響。

二、柱后衍生：是分離物在分析柱中實現(xiàn)分離后，在衍生池內與衍生劑反應，在柱子中分離的是目的物，在檢測器處檢測的衍生產物。

1、優(yōu)點：重現(xiàn)性好，影響因素少，引入物質比較少；分析物可以在其原有的形式下進行分離，容易選用已有的分析方法。

2、缺點：對于一定的溶劑和有限的反應時間來說，目前只有有限的反應可供選擇；可能有擴散問題；對于設備要求較高。