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麥克奧迪賦能時空轉(zhuǎn)錄基因組學(xué)研究

      發(fā)布時間:2025-05-14
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時空轉(zhuǎn)錄基因組學(xué)(Spatially Resolved Transcriptomics, SRT)是近年來發(fā)展迅速的一個研究領(lǐng)域,它結(jié)合高分辨率的空間位置信息和轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù),以解析組織或細胞中基因表達的空間分布和時間變化。


時空轉(zhuǎn)錄基因組學(xué)作為一項前沿技術(shù),在發(fā)育生物學(xué)、腫瘤研究、神經(jīng)科學(xué)、免疫學(xué)研究、再生醫(yī)學(xué)、藥物研發(fā)、疾病模型構(gòu)建等多個生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域展現(xiàn)出廣泛的應(yīng)用潛力。

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圖1 空間解析轉(zhuǎn)錄組學(xué)的代表性應(yīng)用

(圖片來源:參考資料[1])


深圳華大生命科學(xué)研究院(以下簡稱華大研究院)作為時空轉(zhuǎn)錄基因組學(xué)領(lǐng)域的主要推動者之一,在2022年聯(lián)合多名科學(xué)家在《Cell》上發(fā)表了題為《Spatiotemporal transcriptomic atlas of mouse organogenesis using DNA nanoball patterned arrays》的研究論文,結(jié)合 DNA 納米球 (DNB) 模式陣列和原位 RNA 捕獲來創(chuàng)建空間增強分辨率組學(xué)測序 (Stereo-seq)。應(yīng)用Stereo-seq生成小鼠器官發(fā)生時空轉(zhuǎn)錄組圖譜(MOSTA),以單細胞分辨率和高靈敏度繪制了小鼠器官發(fā)生過程中轉(zhuǎn)錄變異的動力學(xué)和方向性。這一創(chuàng)新性的圖譜不僅深刻揭示了細胞間差異的分子根源,還清晰展現(xiàn)了大腦組織發(fā)育過程中的微妙變化,為探索遺傳性疾病的復(fù)雜發(fā)病機制提供強有力的工具


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圖2 Stereo-seq芯片工作原理及小鼠胚胎發(fā)育時空轉(zhuǎn)錄組圖譜(圖片來源:參考資料[2])

麥克奧迪助力時空轉(zhuǎn)錄基因組學(xué)研究

值得一提的是,此次時空轉(zhuǎn)錄基因組學(xué)的研究專題成果,離不開高性能顯微鏡這一關(guān)鍵工具的助力——麥克奧迪PA53掃描系列顯微鏡。

麥克奧迪PA53掃描系列顯微鏡,為華大研究院的科研人員提供了洞察微觀世界的窗口。無論是生物樣本的精細結(jié)構(gòu)解析,還是基因表達產(chǎn)物的直觀可視化,PA53掃描系列顯微鏡都能以優(yōu)異的光學(xué)性能、精準(zhǔn)的成像技術(shù)和人性化的操作設(shè)計,助力時空轉(zhuǎn)錄基因組學(xué)研究的深入發(fā)展。

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麥克奧迪助力時空轉(zhuǎn)錄基因組學(xué)研究

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關(guān)于麥克奧迪PA53掃描系列

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PA53掃描系列是麥克奧迪光學(xué)公司自主研發(fā)設(shè)計的數(shù)字切片顯微鏡掃描平臺,它將傳統(tǒng)的玻璃切片進行掃描和無縫拼接,生成包括傳統(tǒng)玻璃切片內(nèi)所有信息的全視野的數(shù)字化切片。目前,該系列顯微鏡被廣泛應(yīng)用于生物樣品的觀察和分析、研究生物醫(yī)學(xué)材料與組織的相互作用、基因表達與檢測等領(lǐng)域,為科研和醫(yī)學(xué)診斷提供重要的手段和方法



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