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冷凍電鏡（Cryo-EM）和普通顯微鏡在多個方面存在顯著的區別。

首先，從定義和原理上來看，冷凍電鏡，全稱冷凍電子顯微鏡技術，是在低溫下使用透射電子顯微鏡觀察樣品的顯微技術。它利用電子束對冷凍樣品進行成像，通過對樣品進行快速冷凍并在低溫下保持其生物活性，從而實現對生物大分子結構的高分辨率成像。而普通顯微鏡則屬于光學顯微鏡，通過利用光學透鏡對光束進行聚焦和放大，使得人眼能夠看到微小的物體。

其次，從功能和應用領域來看，冷凍電鏡主要用于放大物體，特別是用于觀察肉眼看不見或細節看不清楚的光學儀器，如生物大分子的結構，如蛋白質、DNA和RNA等。它在藥物研發、病毒學等領域具有廣泛的應用。而普通顯微鏡則是一種精密的放大儀器，它不僅用于生物學領域觀察細胞、組織和器官的形態結構，還廣泛應用于醫學、化學、地質學、物理學等其他領域。

需要注意的是，盡管冷凍電鏡技術具有許多優點，但其操作和使用也需要高度的專業知識和技能。因此，在使用冷凍電鏡進行研究和實驗時，需要由專業的科研人員和實驗室技術人員進行操作。