影響分子蒸餾冷凍設備蒸發溫度的因素有以下幾點： 分子蒸餾冷凍設備蒸發器管路結油：正常情況下由于潤滑油和制冷劑互溶，在換熱器表面不會形成油膜，可以不考慮油膜熱阻，但在追加潤滑油情況下，必須選用和原來標號相同的潤滑油，防止油膜的產生。
分子蒸餾冷凍設備空氣過濾網堵塞：必須定期更換過濾網，保證分子蒸餾冷凍設備所需的循環風量。干燥過濾器堵塞：為保證制冷剤的正常循環，制冷系統必須保持清潔、干燥，如果系統有雜質，就會造成干燥過濾器堵塞，系統供液困難，影響制冷效果。制冷劑太少，追加制冷劑。
分子蒸餾冷凍設備蒸發器的溫度狀況：正常情況下，蒸發器外表面很冷，其凝露水珠不斷地滴下來，進出風溫度較大，不正常情況，蒸發器表面不太涼,露水不多，或不結露，可聽到制冷劑流動聲音很響，進出風溫差小。其原因是制冷劑量不足，或膨脹閥開啟度小。
根據不同的分子蒸餾冷凍設備生產廠家的機型，對蒸發器的選擇也不一樣，比如箱體式分子蒸餾冷凍設備，使用水箱盤管式蒸發器；開放式分子蒸餾冷凍設備和螺桿式分子蒸餾冷凍設備，則選用殼管式蒸發器；對于耐酸堿分子蒸餾冷凍設備，可選擇鈦管式蒸發器或者不銹鋼板式交換器。一種工業分子蒸餾冷凍設備，可有多種選擇，當然，更可以根據用戶需求來定做。
