C18色譜柱根據極性分為正相柱和反相柱。正相柱大多以硅膠為柱，或是在硅膠表面鍵合-CN、-NH3等官能團的鍵合相硅膠柱；反相柱填料主要以硅膠為基質，在其表面鍵合非極性的十八烷基官能團（ODS）稱為C18柱，其它常用的反相柱還C8、C4、C2和苯基柱等。
C18色譜柱的構造：
由柱管、壓帽、卡套、篩板、接頭、螺絲等組成。柱管多用不銹鋼制成，也可采用厚壁玻璃或石英管，管內壁要求有很高的光潔度。為提高柱效，減小管壁效應，不銹鋼柱內壁多經過拋光。也有人在不銹鋼柱內壁涂敷氟塑料以提高內壁的光潔度，其效果與拋光相同還有使用熔融硅或玻璃襯里的，用于細管柱。
色譜柱兩端的柱接頭內裝有篩板，是燒結不銹鋼或鈦合金，取決于填料粒度，目的是防止填料漏出，柱內徑一般是根據柱長、填料粒徑和折合流速來確定，目的是為了避免管壁效應。
C18色譜柱的使用方法：
1、新柱活化：新的色譜柱活化：采用100%甲醇1ml/min沖洗60min，再換成流動相進行平衡；如果流動相中含有緩沖鹽，在換成流動相前，請使用過渡流動相過渡后再換流動相平衡；
2、色譜柱保存溶液與評價報告一致。
3、在使用過程中如果流動相沒有磷酸緩沖鹽的存在，新柱子在使用之前需用100%的甲醇以0.5~1.0的流速平衡30min左右，進流動相，待系統基線平穩直接進樣即可。做完實驗再用100%的純甲醇以0.5~1.0的流速沖洗30min左右，最后用100%的純甲醇保存。
4、在使用過程中如果流動相有磷酸緩沖鹽的存在，新柱在使用之前需用10%的甲醇水溶液以0.5~1.0的流速沖洗60min左右，將新柱高濃度甲醇溶液*置換掉，進流動相，待系統基線平穩直接進樣即可。做完實驗再用10%的甲醇（色譜純）水溶液以0.5~1.0的流速沖洗60min左右，將色譜柱中緩沖鹽溶液*置換掉，最后用100%的純甲醇清洗色譜柱30min，最后用純甲醇保存色譜柱。
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