全自動固相萃取儀采用高精密計量泵精確控制各種溶液的過柱流速，可自動完成5個基本操作步驟：活化、上樣、淋洗、干燥、洗脫，相對傳統的固相萃取裝置其節約時間、溶劑和人力成本高達95%，至多可同時進行達8樣品的處理。
全自動固相萃取儀的工作原理：
洗脫待測物應選用離子強度較弱但能洗下待測物的洗脫溶劑。
若需較高靈敏度，則可先將洗脫液揮干后，再用流動相重組殘留物后進樣。體內樣品洗脫后多含有水，可選用冷凍干燥法。
保留能力較弱的SPE填料可用小體積、較弱的洗脫液洗下待測物，再用性較強的HPLC分析柱如C18柱分析洗脫物。
若待測物可電離，可調節pH值，抑制樣品離子化，以增強待測物在反相SPE填料中的保留，洗脫時調節pH值使其離子化并用較弱的溶劑洗脫，收集洗脫液后再調節pH值使其在HPLC分析中達到分離效果。
在洗脫過程中應減慢流速，用兩次小體積洗脫代替次大體積洗脫，回收率高。
全自動固相萃取儀要如何分類？
1、按用途可分為：小體積樣品全自動固相萃取儀和大體積樣品全自動固相萃取儀。
小體積樣品指食品、藥品、血液等樣體，體積量一般在20ml以下；而大體樣品主要指水樣。
2、按原理分可分：為柱萃取和膜萃取全自動固相萃取儀。
膜萃取主要為大體積水樣而設計的，膜萃取速度快是其優點，而且不容易堵塞，
3、按通道分：可分為單通道和多通道固相萃取儀。
通常通道數量越多，在處理大批量樣品時，就可以節約更多的時間，特別是上樣的時間。
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