對于慢性腰腿痛患者，在子午流注理論認為氣血流經相關經絡穴位的特定時間，使用治療儀進行電刺激。例如，一位患有腰椎間盤突出癥導致長期腰部疼痛的患者，經過一段時間的子午流注開穴治療后，疼痛明顯減輕，活動能力得到改善。

偏頭痛患者，根據子午流注規律刺激頭部穴位，有效減少了頭痛發作的頻率和強度。

針對中風偏癱患者，在適宜時間刺激肢體對應的穴位，有助于恢復肢體功能。有患者在接受治療后，從原本無法自主活動上肢，逐漸能夠進行簡單的抓握動作。

對于帕金森病患者，通過子午流注開穴治療儀刺激特定穴位，可一定程度上緩解肌肉僵直和震顫癥狀。

對于長期失眠的患者，在氣血流經與睡眠相關穴位的時間進行治療。比如，刺激神門、內關等穴位，幫助患者調整睡眠節律，提高睡眠質量。有不少患者反饋，經過一段時間的治療，入睡時間縮短，睡眠深度增加。

對于功能性消化不良患者，在相應時辰刺激足三里、中脘等穴位，促進胃腸蠕動，改善消化功能。一位患者原本經常出現腹脹、食欲不振的情況，經過治療后，消化狀況得到明顯改善。

對于月經不調的女性，在特定時間刺激關元、血海等穴位，調節內分泌，改善月經周期和經量。有的患者在接受幾個療程的治療后，月經恢復正常。