近幾十年來色譜作為一種強大的分離技術與MS等檢測手段的聯用得到了很大的發展，色譜法的應用可以根據目的分為制備性色譜和分析性色譜兩大類。
制備性色譜的目的是分離混合物，獲得一定數量的純凈組分，這包括對有機合成產物的純化、天然產物的分離純化以及去離子水的制備等。相對于色譜法出現之前的純化分離技術如重結晶，色譜法能夠在一步操作之內完成對混合物的分離，但是色譜法分離純化的產量有限，只適合于實驗室應用。
分析性色譜的目的是定量或者定性測定混合物中各組分的性質和含量。定性的分析性色譜有薄層色譜、紙色譜等，定量的分析性色譜有氣相色譜、高效液相色譜等。色譜法應用于分析領域使得分離和測定的過程合二為一，降低了混合物分析的難度縮短了分析的周期，是比較主流的分析方法。
其中液相色譜的應用領域有：
在生命科學領域的應用
氨基酸、多肽、蛋白質、核堿、核苷、核苷酸、核酸(RNA、DNA)等重要的生命物質，可以采用液相色譜儀純化和分析測定。
藥物分析
合成藥物的純化及質量控制，中草藥有效成分的分離制備及純度測定以及臨床醫學的藥代動力學研究中的分離分析都采用液相色譜儀解決。除聚合物外，約80%的藥物都能用液相色譜儀進行分離和純化。
食品分析
食品本身組成，特別是營養成分，如糖、有機酸、維生素、蛋白質、氨基酸、脂肪的分析。
食品添加劑，如防腐劑、抗氧化劑、合成色素、甜味劑和保鮮化學物質的分析。
食品污染物，如農藥殘留等的分析。
環境監測
用于分子量大，揮發性低、熱穩定性差的有機污染物的分離和分析。如多環芳烴、酚類、多氯聯苯、鄰苯二甲酸酯類、聯苯胺類，陰離子和非離子表面活性劑、有機農藥等。它已成為環境科學領域中重要的分析手段。
精細化工產品分析
對于一些具有較高分子量和較高沸點的有機化合物，如高碳數脂肪族或芳香族的醇、醛和酮、醚、酸、酯等化工原料，以及各種表面活性劑、藥物、農藥、染料等化工產品，均可液相色譜儀分析。
液相色譜法的應用十分廣泛，一臺液相色譜儀的價格少則幾萬元，多則幾十萬，這么貴的色譜儀如果不好好保養維護，一旦出現了故障損失是巨大的。色譜耗材作為色譜儀經常使用并且更換的配件，選擇一款經久耐用、質量有保障的產品對色譜儀的損害也會大大減低。恒譜生液相色譜耗材產品采用不銹鋼和PEEK材質制作，耐高溫、耐高壓、韌性好、過濾精度高。
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