微生物多樣性測序

微生物多樣性測序是基于二代高通量測序技術對樣品中的優勢物種、稀有物種以及一些未知的物種進行檢測，獲得樣品中的微生物群落組成以及它們之間的相對豐度。具有低成本、高通量、流程自動化等優勢。

擴增子測序

• 16S rRNA測序（細菌多樣性研究）

• 18S rRNA測序（真核微生物多樣性研究）

• ITS測序（真菌多樣性研究）

宏基因組測序
2005 年，加州大學伯克利分校的 Kevin Chen 和Lior Pachter 將宏基因組定文為“應用現代基因組學的技木直接研究自然狀態下的微生物的有機群落，而不需要在實驗室中分離單一的菌株"的科學。宏基因組測序是以特定生境中的整個微生物群落作為研究對象，提取環境樣本總 DNA，獲得環境微生物基因信息總和，研究環境微生物的群落結構、物種分類、基因功能及代謝網絡等，具有通量高、速度快、信息全等特點，在鑒定低豐度的微生物群落、挖掘更多基因資源方面具有很大優勢。

實驗流程：樣品準備、DNA提取、DNA檢測、文庫制備、文庫質檢、上機測序、生信分析

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