修飾的DNA 亞磷酰胺和RNA 亞磷酰胺在研究中發揮著至關重要的作用，因為它們允許將特定的化學修飾引入核酸中，從而能夠研究結構功能關系、基因表達調控以及基因編輯和 RNA 干擾 (RNAi) 等治療應用。
最近，科學家（見下文參考文獻）研究了 RNA 干擾作為靶向基因沉默工具的潛力及其在基因技術和治療開發中的應用。RNAi 是一種自然防御機制，利用短干擾 RNA (siRNA) 來沉默特定基因。這些 siRNA 形成 RNA 誘導的沉默復合物 (RISC)，可降解目標 mRNA 序列，從而導致基因沉默，但不會引起非特異性 RNA 降解。這種特異性使得 siRNA 成為研究生物功能的有力工具和多種疾病的潛在治療劑。
研究人員合成了三種雙鏈體 RNA，其中修飾的核苷取代了 siRNA 3' 突出端區域中未修飾的核苷。修飾的核苷是基于對肝細胞核因子4a (HNF4α)（一種參與肝臟發育和組織特異性特征表達的核激素受體）的研究而設計的，以提高針對該受體的siRNA功效。體外實驗表明，與未修飾的 siRNA 相比，修飾核苷的 siRNA 能夠更有效地抑制 HNF4α。
修飾 siRNA 的合成涉及修飾核苷的制備以及隨后 siRNA 分子的組裝（圖 1 和 2）。采用亞磷酰胺化學合成修飾的核苷，然后使用自動 DNA/RNA 合成儀將其摻入 siRNA 鏈中。所得的 siRNA 通過高效液相色譜 (HPLC) 純化，以確保高純度。
圖 2. 使用 21 個修飾核苷合成的修飾 siRNA 寡核糖核苷酸之一，
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