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豬傳染性胃腸炎/豬流行性腹瀉病毒/豬A組輪狀病毒PCR試劑盒
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提供商
上海晅科生物科技有限公司
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【產品名稱】
商品名稱:豬傳染性胃腸炎/豬流行性腹瀉病毒/豬 A 組輪狀病毒(TGEV/PEDV/PRV-A)核酸檢測試劑盒(三重熒光 PCR 法)
Name: Transmissible Gastroenteritis Virus , Porcine Epidemic Diarrhea Virus and Porcine Rotavirus Type A Detection Kit(Real-Time PCR Method)
【包裝規格】25T/盒、50T/盒
【預期用途】
豬傳染性胃腸炎(TGEV)、豬流行性腹瀉(PEDV)及豬 A 組輪狀病毒(PRV)感染,是豬場常見的病毒性腹瀉,此三種病毒性腹瀉造成了豬場飼料報酬降低、藥物和人力增加等重大損失,是危害豬場最嚴重的 疾病之一。三者均為高度接觸性腸道疾病,具有相似的臨床表現及傳染途徑,其鑒別診斷通常需要借助實驗 室診斷技術。PCR 技術具有特異性強,敏感度高,可進行活體診斷等特點,在實驗室診斷中具有較突出的優勢。本試劑盒適用于檢測標本中的豬傳染性胃腸炎、豬流行性腹瀉病毒和豬 A 組輪狀病毒,適用于豬傳染性胃腸炎、豬流行性腹瀉病毒、豬 A 組輪狀病毒感染的輔助診斷及流行病學調查。
【檢驗原理】
本試劑盒用豬傳染性胃腸炎、豬流行性腹瀉病毒、豬 A 組輪狀病毒的特異性引物和探針,用一步法熒光RT-PCR 技術對豬傳染性胃腸炎、豬流行性腹瀉病毒、豬輪狀病毒 RNA 進行體外擴增檢測,用于科研實驗中對可疑感染者的病原學檢測。
【試劑組成】
包裝規格25T/盒50T/盒
TGEV/PEDV/PRV-A 反應液500μL×1 管500μL×2 管
酶液25μL×1 管50μL×1 管
TGEV/PEDV/PRV-A 陽性質控品50μL ×1 管50μL ×1 管
陰性質控品250μL ×1 管250μL ×1 管
說明:不同批號的試劑盒組分不可交互使用。
【儲存條件及有效期】
-20℃±5℃,避光保存、運輸、反復凍融次數不超過 5,有效期 9 個月。
【適用儀器】
ABI 7300 、7500 、ABI Stepone/Stepone Plus 、安捷倫 MX3000P/3005P 、Roche Gene 6000 、Roche LC480 、
Bio-RadCFX96 等熒光定量 PCR 檢測儀。
【標本采集】
剖檢豬取腸內容物和腸系膜淋巴結;待檢活豬,取排泄物,于離心管中。
【保存和運輸】
上述標本短期內可保存于-20℃,長期保存可置-70℃,但不能超過 6 個月,標本運送應采用 2~8℃冰袋運輸,嚴禁反復凍融。
【使用方法】
1.樣品處理(樣本處理區)
1.1樣本前處理
組織:分別從腸系膜淋巴結的 3 個不同位置取樣,稱取樣品約 1g,用手術剪剪碎混勻,再稱取 0.5g 于研磨器中研磨,加入 1.5mL 生理鹽水繼續研磨,待勻漿后轉至 1.5mL 滅菌離心管中,8000rpm 離心 2min,取上清液 100μL 于 1.5mL 滅菌離心管中;排泄物:取 0.5g 于 1.5mL 滅菌離心管中,加入 1mL 生理鹽水渦旋振蕩, 8000rpm 離心 2min,取上清液 100μL 于 1.5mL 滅菌離心管中。
1.2核酸提取
推薦采用公司生產的核酸提取或純化試劑(磁珠法或離心柱法)進行核酸提取,請按 照試劑說明書進行操作。
2.試劑配制(試劑準備區)
根據待檢測樣本總數,設所需要的 PCR 反應管管數為 N(N=樣本數+1 管陰性對照+1 管陽性對照;反應管數每滿 10 份,多配制 1 份),每測試反應體系配制如下表:
試劑TGEV/PEDV/PRV-A 反應液酶液
用量20μL1μL
將混合好的測試反應液分裝到 PCR 反應管中,21μL/管。
3.加樣(樣本處理區)
將步驟 1 提取的核酸、陽性質控品、陰性質控品各取 4μL,分別加入相應的反應管中,蓋好管蓋,混勻, 短暫離心。
4.PCR 擴增(核酸擴增區)
4.1將待檢測反應管置于熒光定量 PCR 儀反應槽內;
4.2設置好通道、樣品信息,反應體系設置為 25μL;熒光通道選擇: 檢測通道(Reporter Dye)FAM、TEXAS RED、CY5, 淬滅通道(Quencher Dye)ABI 系列儀器請勿選擇 ROX 參比熒光,選擇 None 即可。
4.3推薦循環參數設置:
步驟循環數溫度時間收集熒光信號
11cycle42℃20min否
21 cycle95℃10min否
340 cycle94℃15sec否
55℃30sec是
5.結果分析判定
5.1結果分析條件設定
設置 Baseline 和 Threshold:一般直接按機器自動分析的結果分析,當曲線出現整體傾斜時,根據分析后圖像調節 Baseline 的 start 值(一般可在 3~15 范圍內調節)、stop 值(一般可在 5~20 范圍內調節),以及 Threshold 的 Value 值(上下拖動閾值線至高于陰性對照),重新分析結果。
5.2結果判斷
FAM 通道為豬流行性腹瀉病毒檢測結果,CY5 通道為豬傳染性胃腸炎病毒檢測結果,TEXAS RED 通道為豬 A 組輪狀病毒檢測結果
陽性:檢測通道 Ct 值≤35,且曲線有明顯的指數增長曲線;
可疑:檢測通道 35<Ct 值≤38,建議重復檢測,如果檢測通道仍為 35<Ct 值≤38,且曲線有明顯的增長曲線,判定為陽性,否則為陰性;
陰性:樣本檢測結果 Ct 值>38 或無 Ct 值。
6.質控標準
陰性質控品:Ct>38 或無 Ct 值顯示;
陽性質控品:擴增曲線有明顯指數生長期,且 Ct 值≤32; 以上條件應同時滿足,否則實驗視為無效。
7.檢測方法的局限性
1.樣本檢測結果與樣本收集、處理、運送以及保存質量有關;
2.樣本提取過程中沒有控制好交叉污染,會出現假陽性結果;
3.陽性對照、擴增產物泄漏,會導致假陽性結果;
4.病原體在流行過程中基因突變、重組,會導致假陰性結果;
5.不同的提取方法存在提取效率差異,會導致假陰性結果;
6.試劑運輸,保存不當或試劑配制不準確引起的試劑檢測效能下降,出現假陰性或定量檢測不準確的結果;
7.本檢測結果僅供參考,如須確診請結合臨床癥狀以及其他檢測手段。
【注意事項】
1.所有操作嚴格按照說明書進行;
2.試劑盒內各種組分使用前應自然融化,完-全混勻并短暫離心;
3.反應液應避光保存;
4.反應中盡量避免氣泡存在,管蓋需蓋緊;
5.使用一次性吸頭、一次性手套和各區專用工作服;
6.樣本處理、試劑配制、加樣需在不同區進行,以免交叉污染;
7.實驗完畢后用 10%次氯酸或 75%酒精或紫外燈處理工作臺和移液器;
8.試劑盒里所有物品應視為污染物對待,并按照《微生物生物醫學實驗室生物安全通則》進行處理。