日本藥典是由日本政府發布的，1886年6月25日發布，1887年7月1日開始實施。根據日本《藥事法》(DAL)論文41-1的規定，為了標準化并控制藥物的性質和質量，內閣在聽取藥政管理和食品衛生委員會(PAFSC)的意見后，確定并發布日本藥典。日本藥典確保藥物質量的guan方、公共和明確標準。

目前，日本藥典主要分為兩部分：第一部分包括通則、制劑總則、一般試驗法及781種藥品條目，主要收載原料藥及其制劑;第二部分包括生藥總則以及469種藥品條目，收載生藥、家庭用藥制劑和制劑原料。藥典正文部分按字體順排列，冠有流水號和詳細的國際命名法、分子式、性質、用途、物理數據及參考文獻等，而書后更是附有大量資料、數據表解和索引。值得說明的是，為了方便查找藥品和制劑，該藥典提供了日文、拉丁文和英文共三種語言索引。

日本藥典的作用：

用于藥物管理--新實體批復質量評價和藥物警戒質量保證的標準。

用于制藥工業--在藥物開發中應參考的科學技術標準。

用于藥物教育--藥物科學中質量教科書。

用于國際協調--在藥物質量的國際協調中發揮著積極作用。

2011年日本厚生勞動省制定了最新版本日本藥典-JP16，生效日期為2011年4月1日。