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Namocell分選單個植物原生質體用于單細胞測序
2022年11月28日， Zhan et al.研究團隊在The Plant Journal雜志發表文章Coexpression network and trans-activation analyses of maize reproductive phasiRNA loci，鑒定了與玉米花藥發育相關的時序基因共表達網絡（模塊），包括兩個高度富集的21-或24-PHAS位點的模塊。
作者利用Bulk-protoplast RNA測序對玉米原生質體進行逆轉錄分析，發現2個與21-PHAS位點共表達的轉錄因子可以激活幾個21個核苷酸phasiRNAs通路基因，但不能激活21-PHAS位點的轉錄。同時使用單細胞（原生質體）RNA測序的24-PHAS位點的轉錄調控因子，也都沒有檢測到21-PHAS或24-PHAS位點的可重復激活。研究結果表明，玉米花藥中的內源性轉錄機制和/或染色質狀態是激活生殖PHAS位點所必需的。
【重點】通過單細胞（原生質體）RNA-Seq篩選共同調控生殖PHAS位點的TF組合
為了確定減數分裂前轉錄因子的任何組合是否可以共同激活21-PHAS位點或與21-核苷酸phasiRNA通路相關的基因，作者在玉米葉片原生質體中瞬時表達了上述原生質體RNA-Seq分析中使用的所有結構，包括23個轉錄因子結構和p35S：：GFP質粒。使用Namocell Hana單細胞分離儀分離GFP陽性原生質體，其中96個單原生質體，以下稱為PS1（原生質體組合1），用于單細胞（原生質體）RNA-Seq處理。為了確定MS23、MS32、bHLH51和bHLH122的任何組合是否可以共同激活24個-PHAS位點或24個核苷酸的phasiRNA通路基因，作者還對另一組96個原生質體（原生質體組合2；PS2）進行了單一原生質體RNA-Seq實驗，轉染了8個表達4個bHLHs的質粒，每個都作為與GFP的N端和c端融合，以及p35S：：GFP（表S11）。所有192個原生質體的PCA顯示，這兩個細胞群在第二主成分上可以很好地分離出來（圖4a），表明兩個TF構建庫在原生質體中激活了不同的基因表達程序。在每一組原生質體中，表達大量結構的原生質體通常與那些沒有可檢測到的構建特異性轉錄本的原生質體不同（圖4a），這進一步支持了單個原生質體的不同轉錄組譜是由于轉錄因子的異位表達所致的觀點。
Namocell單細胞分離儀
輕 柔 - 壓力小于 2psi，保護細胞活性
快 速 - 分選快（1min），初始化快（2min），樣本切換快（1min）
精 準 - 配備 2-11 色熒光通道，精準捕獲目的細胞
無 菌 - 一次性無菌芯片，隔絕樣本污染
輕 松 - 無需調校，開機即用
輕 巧 - 體積小巧，方便搬動
Namocell 是一家成立于美國硅谷的專注于單細胞分選技術的生物儀器公司，2022年7月加入Bio-Techne。公司自主研發的微流控單細胞分選平臺，使復雜的單細胞分選變得極其簡單快速，極大地推動了單細胞分析在基礎研究和臨床上的應用。我們的單細胞分選儀已在細胞株的構建，單克隆抗體的篩選，細胞基因編輯，基因及細胞治療，癌癥液體活檢，癌癥免疫治療，產前基因篩查，噬菌體展示，單細胞基因組學等多方面得到廣泛的應用。目前Namocell微流控單細胞分選儀已經被世界各大頂尖研究機構及生物制藥公司廣泛應用于生命科學研究的各個領域，例如美國國立衛生研究院(NIH)，美國食品藥品監督管理局 (FDA)，美國疾病控制與預防中心(CDC)，哈佛大學，斯坦福大學，麻省理工大學，Genentech，Merck，Biogen，BMS，Janssen，Boehringer-Ingelheim等。