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發酵罐已滅菌部分于未滅菌部分之間不得直接連通，防止細菌繁殖進入盡量減少法蘭連接，以免法蘭連接處因設備振動和熱膨脹移位而導致污染防止形成死角、裂縫等，這些地方容易藏有不被熱破壞的污染菌部分結構可單獨滅菌與發酵罐相通的然后活動連接都應利用蒸汽進行密封所有閥門應易于清洗、維修和滅菌發酵罐結構應能夠始終保持正壓，以防止向罐內滲漏發酵罐使用不銹鋼制造，小于30L的小型發酵罐可用玻璃制造通風發酵附屬設備空氣除菌設備消泡裝置發酵罐的冷卻裝置空氣除菌裝置過濾除菌原理：微生物微粒在隨氣流通過濾層時，在改變運動速度和運動方向。

1.繞過纖 維前進的過程中，將因濾層行為產生慣性沖擊、阻攔、重力沉降、布朗擴散、靜電吸引等作用而把微粒滯留在纖維表面典型空氣過濾除菌流程：環境污染比較嚴重的地方要改變吸風的條件，以降低過濾器的 負荷，提高空氣的無菌程度。溫暖潮濕的地方要加強除水措施以確保和發揮過濾器的大除菌效率。

2.在壓縮機耗油嚴重的設備流程中則要強調消除油霧的污染等簡單，適合于氣候寒冷，相對濕度很低的地區或季節使用比較完善的空氣除菌流程，能充分分離油水，使空氣達到低的相對濕度后進入過濾器， 提高過濾效率，可適應各種氣候條件，尤其適用于潮濕的南方地區消泡裝置形成原因：微生物的菌體代謝過程產生的氣體聚結而成，通入的空氣被攪拌器打散而成；與培養液的固形物性質有關，含蛋白質高的原料易產生泡沫，含糊精、糖蜜多的發酵液。