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小分子
MW < 2000

大分子
MW > 2000

填料孔徑的shou'要選擇條件是基于待分析分子的大小。典型的小分子可以輕松地在標準 80-120Å 孔徑填料的孔內外擴散，但多肽和蛋白質則可能不行。鑒于此原因，建議使用
300Å 孔徑填料 (300SB) 對多肽和蛋白質進行等度或梯度分離。

對于多數樣品，一般推薦使用 C18 為起始色譜柱鍵合相，因為它能為中等極性到非極性的化合物提供zui大的保留。如果用 C18 固定相無法優化分離或您正在分析較大的蛋白質，應考慮使用短鏈固定相。

色譜柱內徑決定了您可以在柱上進樣多少物質（質量）— 內徑越小，要保持良好峰形能進樣的物質就越少。較小內徑的色譜柱提高了靈敏度，因此普遍用于 LC/MS 和樣品量有限的應用。