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　　賽默飛離子阱質譜是利用高電場使質譜進樣端的毛細管柱流出的液滴帶電，在氮氣氣流的作用下，液滴溶劑蒸發，表面積縮小，表面電荷密度不斷增加，直至產生的庫侖力與液滴表面張力達到雷利極限，液滴爆裂為帶電的子液滴，這一過程不斷重復使終的液滴非常細小呈噴霧狀，這時液滴表面的電場非常強大，使分析物離子化并以帶單電荷或多電荷的離子形式進入質量分析器。賽默飛離子阱質譜從液相中產生離子，一般說來，肽段的混合物經過液相色譜分離后，經過偶聯的與在線連接的離子阱質譜分析，給出肽片段的的氨基酸序列,但是分析時間一般較長。
 

　　賽默飛離子阱質譜在蛋白質組學和小分子應用上奠定了新的里程碑。在得到充分證明的高性能平臺上，運用新的離子阱技術，極大地提高了速度、分辨率、MS/MS效率和定量分析的重復性，從而達到的高性能。
 

　　1、極短的MS/MS循環時間，zui大的信息量。

　　2、全新的SMART離子隔離和碎裂技術。

　　3、ETD性能：靈敏度高、耐性好、可靠性強。

　　4、雙離子漏斗技術提高的靈敏度。

　　5、當今世上分辨率zui高的離子阱質譜儀，在全掃描模式下，分辨率高達30, 000。

　　6、賽默飛的RF發生器確保zui高的質量精度。

　　7、高達20 Hz數據采集速度，并且實現“零時間延遲”正負模式切換。

　　賽默飛離子阱質譜滿足蛋白質組學研究的速度：

　　1、自下而上(Bottom-up)方法，鑒定到更多的低豐度蛋白質。

　　2、杰出的ETD/PTR技術，的翻譯后修飾分析。

　　3、自上而下測序 (Top-Down sequencing; TDS)，zui高序列覆蓋率。