島津氣質聯用儀被廣泛應用于復雜組分的分離與鑒定，其具有GC的高分辨率和質譜的高靈敏度，是生物樣品中藥物與代謝物定性定量的有效工具。質譜儀的基本部件有：離子源、濾質器、檢測器三部分組成，它們被安放在真空總管道內。接口：由GC出來的樣品通過接口進入到質譜儀，接口是氣質聯用系統的關鍵。
島津氣質聯用儀的色譜部分：
色譜部分和一般的色譜儀基本相同，包括柱箱、氣化室和載氣系統。除特殊需要，多數不再裝檢測器，而是將MS作為檢測器。此外，在色譜部分還帶有分流/不分流進樣系統，程序升溫系統，壓力、流量自動控制系統等。
色譜部分的主要作用是分離，混合物樣品在合適的色譜條件下被分離成單個組分，然后進入質譜儀進行鑒定。
色譜儀是在常壓下工作，而質譜儀需要高真空，因此，如果色譜儀使用填充柱，必須經過一種接口裝置-分子分離器，將色譜載氣去除，使樣品氣進入質譜儀。如果色譜儀使用毛細管柱，因為毛細管中載氣流量比填充柱小得多，不會破壞質譜儀真空，可以將毛細管直接插入質譜儀離子源。
島津氣質聯用儀的使用方法：
一、開機順序1、打開氦氣瓶，將分壓表調到0.5-0.6Mpa之間。
2、打開質譜儀電源開關。
3、打開氣譜電源開關。
4、打開計算機。
二、進入系統及檢查系統配置
1、打開氣質控制軟件。
2、開機抽真空24h后，點擊視圖→調諧和真空檢測，選擇調諧→atune（自動調諧）（長期不用\或有異常需調諧）。
3、調用已建立的測試方法，調用已建立的序列，運行序列。
4、打開氣質數據處理軟件，調用數據，分析數據。
三、開機順序
1、關閉數據分析軟件，氣質控制軟件后關閉計算機。
2、關閉氣譜電源開關。
3、關閉質譜儀電源開關。
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