數碼顯微鏡又叫視頻顯微鏡，它是將顯微鏡看到的實物圖像通過數模轉換，使其成像在顯微鏡自帶的屏幕上或計算機上，主要用于教學用途。
數碼顯微鏡的主要好處在于：傳統的光學顯微鏡只能供一人使用，要分享顯微鏡的影像很困難，而要拍攝顯微鏡內的影像，亦往往需要用到特別的儀器幫助。然而，數碼顯微鏡由于可以與電腦接駁，使顯微鏡內的視像可以透過連接到課室的投影機播放，使課室內的學生可以一同觀看影像，對課堂秩序的管理亦有幫助。
數碼顯微鏡與普通顯微鏡之間的不同，有下面的六大區別：
1．具有顯微攝像功能，把觀察到的顯微效果保存下來，形成圖文文件，可給相關部門互相傳閱；普通顯微鏡只能通過目鏡觀察，不能進行顯微攝像。
2．與電腦相接，可以實現多人同時觀察；普通顯微鏡只能一人觀察。
3．通過電腦屏幕預覽，可以減少眼睛疲勞；普通顯微鏡則需要每時每刻通過目鏡觀察，容易造成眼睛過度疲勞。
4．數碼顯微鏡的成像裝置可以有測量，打印圖文報告，錄像等功能；普通顯微鏡只能單純的進行顯微觀察。
5．數碼顯微鏡是現代科學儀器儀表發展的一個新時代，具有很多普通顯微鏡沒有的功能。它在科學研究、產品檢測、教學演示、考古等方面都有迅速的發展。
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