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技術文章

猴B皰疹病毒熒光定量 PCR 檢測試劑盒使用步驟

閱讀:214          發布時間:2019-8-7

 猴B皰疹病毒熒光定量 PCR 檢測試劑盒使用步驟

一、樣品 DNA 的制備

1.用自選方法純化樣品的 DNA,本試劑盒跟市場上大多數病毒 DNA 提取試劑盒兼容。也可以選購本公司的柱式病毒 DNAout。

二、引物的制備(在樣品制備室進行)

2.按引物標簽提示在裝引物干粉的管中直接加入適量的超純水(加入量見引物試管上的標簽),使得兩條引物的濃度均為 10 μM(10 pmol/μL),然后各取 50 μL混合在一起,標注為引物混合物,放冰上待用。

三、稀釋陽性對照(以 10E2-10E7 這 6 個 10 倍稀釋度為例。由于標準品濃度非常高,

因此下列稀釋操作一定要在獨立的區域進行,千萬不能污染樣品或本試劑盒的其他成

分)。為增加產品穩定性和避免擴散傳染性病原,本產品不提供活體樣品做陽性對照,

  猴B皰疹病毒熒光定量 PCR 檢測試劑盒(染料法)

 Herpesvirus simiae qPCR Kit(Dye based)                                     CAT#:11-180703

只提供可以直接使用的長為 124bp 的 DNA 片段作為陽性對照。3. 標記 6 個離心管,分別為 7,6,5,4,3,2。

4.用帶芯槍頭分別加入 45 μL 超純水(用帶芯槍頭,下同)。

5.先將本試劑盒提供的陽性對照用超純水 10 倍梯度稀釋到 10E8 拷貝/μL。放冰上待用。

6.在 7 號管中加入 5 μL 10E8 拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩 1 分鐘,得 10E7 拷貝/μL 的陽性對照。放冰上待用。

7.換槍頭,在 6 號管中加入 5 μL 10E7 拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩 1 分鐘,得 10E6 拷貝/μL 的陽性對照。放冰上待用。

8.換槍頭,從 6 號管中取 5 μL 溶液到 5 號管中,充分震蕩 1 分鐘,得 10E5 拷貝/ μL 的陽性對照。放冰上待用。

9.換槍頭,從 5 號管中取 5 μL 溶液到 4 號管中,得 10E4 拷貝/μL 的陽性對照。放冰上待用。重復上面的操作直到得到 6 個稀釋度的陽性對照。放冰上待用。

三、設置 PCR 反應(20 μL 體系,在樣品制備室進行)

10.在 PCR 管中加入下列成分(待測樣品需要做三次重復,下表只列出一次。樣品管和陰性對照設置完畢后才設置陽性對照,并且陽性對照樣品要等所有管子蓋上蓋子儲存好后后加):

成分 樣品 陰性對照 陽性對照(2-7 管)

2×qPCR Mix 10 μL 10 μL 各 10 μL

引物混合物 2 μL 2 μL 各 2 μL自備 10×ROX (見注) 2 μL 2 μL 各 2 μL

待測樣品 DNA 模板 1-5 μL 不加 不加

各 5μL(2 號樣到陽性對照(2-7 號) 不加 不加 2 號管,3 號樣到 3

號管…)

補水到 20 μL 20 μL 20 μL

注:僅 ABI7500、7700 和 7900 儀器需要使用ROX 作為對照,其他熒光 PCR 儀器(如 iCycler IQ、MJ Option、MJ Chromo4、MX3000、MX4000、RotorGene 3000、RotorGene 6000 和 LightCycler480)不需要使用 ROX。

11.蓋上蓋子后上機,按下面參數進行 PCR(具體 PCR 參數可以根據儀器不同而自行

優化)。

過程 溫度 時間

預變性 95℃ 5 分鐘

 

 

PCR 反應

(40 個循環) 95℃ 15 秒

60℃ 60 秒

12.數據采集

具體操作按所用儀器推薦的流程進行。本產品中所含的熒光染料在不結合 DNA 時, 大吸收光譜在 471 nm,結合 DNA 時的大吸收光譜在 500 nm,大發射光譜在 530 nm。

四、數據處理

13.以陽性對照濃度的 log 值為橫軸,以 Ct 值為縱軸,繪制標準曲線。再以待測樣品

濃度的 log 和標準曲線計算出樣品 DNA 的濃度。

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