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慢性炎癥是tp53突變進化的驅動因素,德國MB支原體qPCR檢測助力科研

閱讀:605      發布時間:2023-9-17
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生物藥的研發、上市,需要經歷多個復雜而嚴格的過程,其中就包括支原體檢測。德國MB支原體qPCR檢測試劑盒,靈敏度高、特異性強,通過了歐洲藥典和日本藥典的方法學驗證。

 

腫瘤蛋白53 (TP53)是人類癌癥中最常見的突變基因,通常發生在一個等位基因發生點突變而另一個野生型(WT)等位基因丟失的多命中過程。TP53突變還與拷貝數改變(copy number changes, CNA)和結構變異密切相關,反映了p53在維持基因組完整性中的作用。在髓系惡性腫瘤中,TP53突變的存在定義了一種臨床實體,與復雜的CNA、對常規治療缺乏反應和令人沮喪的結果相關。了解TP53突變驅動克隆進化和疾病進展的機制是開發診斷、分層、治療和潛在預防這種疾病的合理策略的關鍵一步。

 

骨髓增生性腫瘤(MPN)在造血干細胞(HSC)中通過獲得JAK/STAT信號通路基因(JAK2CALRMPL)的突變而產生,導致骨髓譜系的異常增殖。繼發性急性髓系白血病(sAML)發生在10-20%MPN中,其特征是細胞減少、髓系細胞增多、造血干細胞/祖細胞(HSPCs)獲得異常白血病干細胞(LSC)特性,中位生存期不到1年。在大約20-35%mpnsAML (統稱TP53- saml)中檢測到TP53突變,通常與剩余WT等位基因的丟失和多個CNAs有關。此外,Trp53缺失與JAK2 V617F突變聯合導致小鼠高滲透髓系白血病。

 

盡管已經確定TP53突變在MPN轉化中的作用,但在16%的慢性期MPN (CP-MPN)中也存在TP53突變亞克隆,并且在大多數情況下,這并不預示著TP53- saml的發展。

 

然而,對于獲得TP53突變后克隆進化的其他遺傳和非遺傳決定因素知之甚少。要解決這個問題,需要揭示腫瘤內的多層異質性,包括可靠地鑒定TP53突變、WT等位基因的缺失和CNA的存在。

 

發表在《Nature》上,標題為:“Single-cell multi-omics identifies chronic inflammation as a driver of TP53-mutant leukemic evolution"的文章,將這種突變景觀與細胞表型和轉錄特征結合起來,將解決TP53-sAMLLSC的異常造血分化和分子特性。這就需要單細胞方法,將HSPCs的分子和表型分析與等位基因分辨率突變檢測相結合,近期TARGET-seq技術實現了這種方法。

 

演技潤園對骨髓增殖性腫瘤轉化為tp53突變的繼發性急性髓系白血病(sAML)患者的造血干細胞/祖細胞(HSPCs)進行了等位基因分辨率單細胞多組學分析。

 

所有患者在轉化時均顯示顯性TP53“多打"HSPC克隆,在獨立隊列中,無論是TP53突變型還是野生型(WT) AML,白血病干細胞轉錄特征都能強烈預測不良結局。通過對序列樣本、先前的TP53雜合克隆和體內擾動的分析,科研人員發現慢性炎癥在抑制TP53 WT HSPCs的同時,增強了TP53突變細胞的適應度優勢,促進了遺傳進化。

 

該項發現將促進tp53突變白血病的風險分層、早期檢測和治療策略的發展,并與其他癌癥類型廣泛相關。


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