自動進樣器是一個自動進樣系統，標準模式下較多可以進120個樣品，它可以作為一個獨立系統獨自使用，也可以組成一個由計算機控制的系統聯合使用。通過不同菜單，可以對單個應用的分析程序隨意改動。對于固定體積進樣而言，樣品的體積由內置的定量環決定，定量環的體積很容易更換。在步進電機驅動的注射器的推進下，定量環由預先選定體積的樣品沖洗，轉動進樣閥后，只有樣品留在樣品環中，進而被沖進色譜柱中。
　　
　　一段由程序設定體積的樣品由進樣針注入系統，在注射器和進樣針之間安裝著轉移毛細管，此部分可以在進樣之前盛裝量好的樣品。這樣就可以使樣品不至于進到注射器中，從而避免污染。為了把一定量體積的樣品送入進樣系統中，進樣針放下針頭，插入進樣口內，然后在注射器的推進下將樣品注入定量環中，由程序設定的一段流動相被吸入到注射器中，這樣可以樣品能夠被送入定量環中，由于這段流動相的作用，樣品會毫無損失的進入樣品環。這段流動相停留在進樣口和進樣環之間的毛細管中，為了避免樣品和洗脫液混合，由程序設置的一段空氣會使兩部分分開。
　　
　　根據需要，自動進樣器可以升級適應其他應用要求：可變進樣體積功能：較大的定量環中可以部分充入樣品，樣品的體積由程序設定。
　　
　　柱前衍生功能：較多可以向每個樣品中添加3種不同的其他試劑與樣品混合，并且可以通過程序設定不同的反應時間。另外，樣品在進入系統之前可以稀釋（較大可達1：100）。
　　
　　溫度控制功能：對溫度敏感的樣品，可以通過內置的Peltier元件實現樣品腔的冷卻或加熱過程。
　　
　　全PEEK系統：對于化學惰性樣品，可以選用全PEEK或FEP材料的進樣針、連接毛細管、進樣閥等制成的自動進樣器。