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硅膠顆粒形狀一般有球形和不規則形。目前絕大多數HPLC色譜柱均為球形填料。球形顆粒的均勻性更容易控制，顆粒分布越均勻，峰形越好；且在使用黏度較大的流動相時，球形顆粒能降低柱壓，延長色譜柱壽命。不規則硅膠顆粒目前在中低壓制備領域使用較多，如前處理SPE小柱。

粒徑，通常指的就是硅膠顆粒的粒徑，液相色譜中常見的粒徑大小主要有10μm，5μm，3μm，2.6μm，1.7μm等。一般來說粒徑越小，色譜柱的柱效越高，靈敏度越高，分離越快，分離效果也越好；同樣，粒徑越小，色譜柱的壓力越高，對儀器的要求也越高，同時也更容易被污染，導致色譜柱壽命降低。

平常用到的作為色譜柱固定相使用的硅膠主要是全多孔硅膠顆粒和表面多孔硅膠顆粒（核殼顆粒）兩種。以全多孔硅膠顆粒為例，下圖所示，硅膠顆粒的內部都是由非常多的小孔構成，這些小孔的直徑大小就是孔徑。

一般要根據分子量的大小來確定孔徑。樣品分子在色譜柱上能有較好的保留，是因為它可以自由進入到填料的微孔里面，能夠與鍵合在填料表面上的固定相相互作用。通常孔徑直徑要大于分子直徑的3倍以上才不會對分析造成影響。常見的小分子化合物，通常分子量小于2000Da的，選擇100?大小的就能滿足測試需求。如果分子量大于2000Da的，如蛋白質類物質，則需要選擇大孔徑如300?的填料。

填料的比表面積指的是每克填料的表面積，不光是硅膠顆粒表面的面積，這只是填料表面積的極少的一部分，更多的是硅膠顆粒內部小孔內部的面積。我們常見的比表面積大小一般在200-500m²/g。一般來說，孔徑越小，含孔率越大，填料表面積則越大。填料比表面積增大，會增加樣品與鍵合相之間的作用，增加保留、分離度和制備時的上樣量。比表面積小，相對可以縮短分析時間和梯度平衡的時間，提高效率。但是比表面積并不是越大或者越小就好，需要選擇適目標物的比表面積。

碳載量就是鍵合在硅膠表面上鍵合相中包含碳原子的數量（也就是填料中碳的含量）。對于反相色譜柱來說，碳載量是一個重要的參數，顯示著色譜柱的保留能力，一般來說，碳載量越大，色譜柱的疏水作用能力越強，對物質的保留越強。通常大家都會認為C18的碳載量一定比C8大，實際并不是這樣。碳載量不光與鍵合相碳鏈的長短有關，還與表面積和固定相的鍵合率有關。碳鏈越長，表面積越大，鍵合率越高，則碳載量越高。因為C8的碳鏈要短，所受到的空間位阻比C18要更小，往往C8的鍵合率要比C18要高，因此，C8的碳載量實際上不會比C18低，反而有的還會比C18要更高。

端基封尾通常用于反相固定相之中。如下圖所示，硅膠表面由游離的硅羥基組成，固定相鍵合在硅羥基上，由于空間位阻的存在，鍵合反應最多只能覆蓋50%的硅羥基，超過一半硅羥基是活性硅羥基，通常處于游離的狀態，容易與目標化合物的堿性基團發生離子交換作用，產生二級作用，導致峰形拖尾。因此，通常會選擇用短碳鏈（如三甲基硅烷TMS）鍵合游離的硅羥基，可以減小這種影響，這種操作就被稱為端基封尾。一定程度上認為，端基封尾的程度，決定著一根色譜柱的使用和性能。

液相色譜中，按鍵合官能團的極性可分為極性鍵合相和非極性鍵合相。

首先是極性鍵合相。常用的極性鍵合相有氰基鍵合相（－CN）、氨基鍵合相（－NH₂）和二醇基鍵合相等。極性鍵合相常用作正相色譜，樣品在極性鍵合相上的分離主要是基于極性鍵合基團與溶質分子之間的氫鍵作用，極性強的組分保留值較大。極性鍵合相有時也可作反相色譜的固定相。

第二是非極性鍵合相。常用的非極性鍵合相有烷基鍵合相（C1～C18）、苯基鍵合相和聯苯基鍵合相等，其中C18鍵合相應用zui廣。非極性鍵合相的烷基鏈長對樣品容量、溶質保留值和分離選擇性都有影響。一般來說，樣品容量隨烷基鏈長增加而增大，長鏈烷基可使溶質保留值增大，常常可改善分離選擇性。短鏈烷基鍵合相具有較高的覆蓋度，分離極性化合物時可得到對稱性較好的色譜峰。苯基鍵合相與短鏈烷基鍵合相的性質相似。