選擇離子交換樹脂的一般原則是選擇交換容量大、容易再生、而且使用耐久的樹脂。具體來說：
(1)交換容量是離子交換樹脂性能的一個重要指標，交換容易越大則同體積的樹脂能吸附的離子越多，一個交換周期的制水量也越大。一般來說，弱酸或弱堿性樹脂比強酸或強堿性的樹脂交換容量大。另外，在同類樹脂中，由于樹脂的交聯度不同，交換容量也不同。一般交聯度小的樹脂交換容量大；交聯度大的樹脂交換容量小。因此在選擇樹脂時要注意。
(2)要根據原水中需要去除離子的性質來選擇樹脂。如果只需要去除水中交換吸附性弱的離子時，則必須選用強酸或強堿性樹脂。
(3)要根據出水水質要求來選擇樹脂。如果只需要部分除鹽的系統，可以選用強酸性陽樹脂和弱堿性陰樹脂配合使用。對于必須*除鹽的純水或高純水系統，則要選擇吸附性較 強的強酸性陽離子交換樹脂和旨堿性陰離子交換樹脂配合使用，以去除較難吸附的離子。
(4)要根據原水中雜質的成分來選擇樹脂。如原水中有機物較多，或去除離子的半徑較大時，應選用交聯孔直徑較大的樹脂。盡量選擇高強度多孔性樹脂。
(5)用于混合床的樹脂，較多的是強酸-強堿性樹脂的組合。但要考慮混合床樹脂再生時分層容易，因此，要求兩種樹脂的濕真密度之差應大一些，一般應不小于15%～20%。另外，還要考慮到混合床運行時交換流速比較大，樹脂磨損較為嚴重的情況，故應選擇耐磨性的樹脂。
(6)要根據除鹽水工藝要求來選擇樹脂。例如雙室床，選用強、弱性樹脂配合使用，因為弱性樹脂容易再生，對再生劑的質量要求也比較低，可以利用強性樹脂再生后的再生液來再生弱性樹脂，這樣，再生劑的消耗低，制水成本低。
