分光光度法中比色皿潔凈與否是影響測定準確度的因素之一。因此，必須重視選擇正確的洗凈方法。
每次使用完畢的比色皿，一般先用自來水沖洗，再用蒸餾水沖洗三次，倒置于干凈的濾紙上晾干，然后存放于比色皿盒中。如果比色皿被有機物污染，宜用鹽酸-乙醇(1+2)混合液浸洗，也可用相應的有機溶劑浸泡洗滌。
如：油脂污染可用石油醚浸洗，鉻天青顯色劑污染可用硝酸(1+2)浸洗等。比色皿不可用堿液洗滌，也不能用硬布、毛刷刷洗。
含有能腐蝕玻璃物質的溶液，如氟化物的高濃度溶液不可放人比色皿中。含氟離子濃度低的溶液也不宜在皿中久置。比色皿質地較脆，石英皿尤甚，使用時動作要輕，切勿摔碰。市場面上一般使用的石英比色皿均為石英粉燒接的，超聲波清洗， 洗比色皿清洗時毛面朝下。
