1、一般情況下，該機不得連續使用超過48小時；
2、一定要保證樣品*凍結成冰，否則將會造成殘留液體轉化為氣態而產生噴射；
3、冷阱溫度約為-65℃，可代替低溫冰箱，但為了防止凍傷必須戴好保溫手套進行操作；
4、出水閥擰緊與否和充氣閥是否關閉，必須是在啟動真空泵以前進行檢查，同時注意有機玻璃罩與橡膠圈的接觸面是否清潔無污物并且密封良好；
5、盡可能擴大制備樣品的表面積，樣品中不應包括含有酸堿物質和揮發性的有機溶劑；
6、在冷凍干燥機冷凍樣品的過程中，溫度會逐漸降低，這時可以將仍處于冰凍狀態的樣品取出回暖一段時間后，在繼續干燥，這樣可以縮短干燥的時間。
冷凍干燥機的使用方法
1、在每次開機之前，shou先檢查真空泵中泵油是否足夠。
2、擰開排水閥門，讓里面殘留的水流出。排干后再擰緊閥門。
3、檢查凍干腔與冷阱的接觸部分是否完好，必要時清潔及重新調整。
4、關閉所有的閥（與凍干瓶直接相連的閥，白色旋鈕向上即為關閉）。關閉冷阱與真空泵想連接的閥（在儀器后面，與真空管相連接）。
5、打開冷阱電源開關，打開真空泵電源開關。
6、15分鐘后，打開冷阱與真空泵相連接的那個閥門。
7、1分鐘以后，即可把已經預凍好的樣品（已經在凍干瓶中）掛在支架上，打開相對應的閥門后即可進行凍干過程。
8、凍干結束后，關閉相對應的閥（白色旋鈕向上），取下凍干瓶。
9、待所有凍干瓶取下后，依次關閉真空泵電源和冷阱電源。
10、待冷阱中的霜融化后，打開排水閥門進行排水，然后關閉。
冷凍干燥機的使用注意事項
1、樣品在凍干之前shou先要進行預凍，樣品必須在固態（結冰狀態）下才能凍干，預凍時間越長凍干效果越好。樣品的體積不要超過樣品瓶體積的1/3。
2、在凍干時如果出現樣品融化現象，并且真空泵及冷阱工作狀態良好的情況下，其原因是真空度不夠，有漏氣的地方。請檢查所有的閥門是否關閉，凍干腔與冷阱表面接觸的地方是否密封，必要時清潔冷阱表面及凍干腔的密封圈。
3、定期清潔冷阱腔及凍干腔。
4、在開機后15分鐘后才可以凍干，目的是先讓冷阱預冷，讓真空泵預熱。這樣才能使儀器在一個的工作狀態工作。
5、凍干結束關閉閥門后，凍干瓶內部與外界相通，待氣壓平衡后即可取下瓶子。
6、定期清潔壓縮瓶內部的灰塵，真空泵中油少時要進行加油。
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