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鹽酸小檗堿主要植物來源于小檗科植物豪豬刺（Berberis Juli-ande Schneid）的根和莖，含量高可達4.5%。
小檗堿以鹽酸鹽的形式存在于植物之中，均為黃色結晶體，游離小檗堿在冷水中溶解1:20；熱水1:8；冷乙醇1:100；熱乙醇1:12；鹽酸鹽水中1:30；硫酸鹽1:15.一種異喹啉生物堿。分子式[C20H18NO4]+。又稱黃連素 。存在于小檗科等4科10屬的許多植物中。小檗堿從乙迷中可析出黃色針狀晶體。熔點145℃。溶于水，難溶于苯、乙迷和氯仿。小檗堿為一種季銨生物堿，其鹽類在水中的溶解度都比較小，例如鹽酸鹽為1∶500，硫酸鹽為1∶30。小檗堿從水或稀乙醇中析出的晶體帶有5.5分子結晶水；若從氯仿、丙酮或苯中結晶，也帶有相應的結晶溶劑分子。
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