(1)在線水質分析儀需要停用、拆除或者更換的，應當事先報經環境保護有關部門批準。運營單位發現故障或接到故障通知，應在24小時內趕到現場進行在線水質分析儀維修處理。
(2)對于一些容易診斷的故障，如電磁閥控制失靈、膜裂損、氣路賭賽、數據儀死機等，可攜帶工具或者備件到現場進行針對性的維修。在線水質分析儀此類故障維修時間不應超過8小時。對不易診斷和維修的儀器故障，若72小時內無法排除，應安裝備用儀器。
(3)在線水質分析儀經過維修后，在正常使用和運行之前應確保維修內容全部完成，性能通過檢測程序，按國家有關技術規定對儀器進行校準檢查。若監測儀器進行了更換，在正常使用和運行之前應對儀器進行一次校驗和比對實驗。
(4)若數據存儲/控制儀發生故障，應在12小時內修復或更換，并保證在線水質分析儀已采集的數據不丟失。
(5)應備有足夠的備品備件及備用儀器，對其使用情況進行定期清點，并根據實際需要進行增購，以不斷調整和補充各種備品備件及備用儀器的存儲數量。
(7)在線水質分析儀因故障不能采集、傳輸數據時，應及時向環境保護有關部門報告，必要時采用人工方法進行監測。在線水質分析儀人工監測的周期應不少于每2周一次。
