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文獻報道的離子色譜儀法對有機酸的分析均采用C18色譜分離柱結合紫外檢測的方法。離子色譜儀樣品預處理方法可分為2 種，第1種只對樣品進行稀釋和過濾，第2種是樣品用離子交換樹脂或固相萃取柱萃取（如SAX陰離子交換萃取柱）以避免糖或色素與有機酸共溶的干擾，研究證實經稀釋過濾后直接進樣比固相萃取法具有更好的精密度和回收率。
余永健等對采用離子色譜儀色譜柱分離固態發酵食醋中9 種有機酸的離子色譜儀分析法進行了優化；王潔等采用Grace以樹脂聚合物為填料的有機酸專用分析柱對醋粉中的12 種有機酸進行分離；Lin等使用Rezex ROA苯乙烯和二乙烯基苯聚合樹脂（苯環有8%被磺化）填料的分析柱成功分離了20 種有機酸；Castro等采用Ion 300離子排阻色譜柱對5 種有機酸進行了分析。這些研究證明色譜柱的性能對分離復雜基質中的多種有機酸至關重要。
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