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快速PCR試劑(Cat#10167ES)
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各擴增酶實際上機用時總時長(包含PCR儀升溫、降溫過程)。
10167ES擴增3 kb片段上機時間僅需59 min!30循環下,6 kb片段上機僅需58 min!相比市面上其他產品,最高立省3.7小時!
以下更有詳細實驗操作解析,今日免費公開!助力實驗黨高效完成實驗!
實驗材料:
DNA樣本:大腸桿菌菌落、大腸桿菌菌液、農桿菌菌落、酵母菌落、小鼠基因組DNA、玉米基因組DNA、水稻基因組DNA。
快速PCR試劑:2×Hieff® Ultra-Rapid II HotStart PCR Master Mix(Cat#10167ES)。
其他試劑:RNase-free H2O或DEPC處理水、相關基因上下游引物(儲存濃度10 μM)。
設備與耗材:移液器、PCR儀、冰盒、離心機、EP管、RNase-free離心管。
實驗步驟:
試劑&樣本前期準備
試劑解凍和混勻
從冰箱中取出:
從-20℃冰箱中取出含酶試劑,立即放入冰盒中(冰上操作)。
避免將試劑直接放在室溫下解凍,以免溫度波動影響酶的活性。
緩慢解凍:
讓試劑在冰上自然解凍,通常需要5-10分鐘。
如果需要快速解凍,可以將試劑握在手中輕輕搖晃,但不要過度加熱。
低速離心:
PCR Mix在1×預混液中含有2 mM Mg2+和200 μM的dNTPs,使用前要充分解凍混勻。
將試劑管短暫離心(5-10秒,1000 rpm左右),使管壁和管蓋上的液體集中到管底。
離心后置于渦旋儀震蕩10 sec混勻,確保試劑均勻分布。
混勻后的試劑應繼續放在冰上,避免長時間暴露在室溫下。
如溶解后,暫未使用,可暫時儲存于4度放置。
Tips:混勻時盡量避免產生氣泡,氣泡可能會影響酶的活性或實驗結果的準確性。
模板稀釋(若需要)
以下是針對不同模板,PCR反應時推薦的使用量:
用無菌超純水稀釋DNA或者線性化載體至目標濃度。
Tips:模板DNA在儲存的過程中會有一定程度的降解,儲存前測試的濃度不一定準確,為了保證實驗精度,在放置一段時間后,需重新測試DNA模板濃度。
不同模板擴增1 kb目的片段比對測試
以大腸桿菌菌落、農桿菌菌落為模板:盡量使用新鮮長滿的平板,大腸桿菌、農桿菌平板4度存放不得超過45天。
以大腸桿菌菌液為模板:使用新鮮搖菌的大腸桿菌菌液。挑取單菌落至1 mL液體培養基中,37℃搖床180 rpm培養3-4 h,至菌液渾濁但偏澄清的狀態,使用分光光度計測試OD600下的菌液濃度,OD600=0.5-0.6最佳。
Tips:OD600不宜超過1.2,菌液太濃會抑制擴增。
以小鼠、玉米、水稻基因組DNA為模板:根據10167ES說明書中基因組添加量進行樣本稀釋,本實驗預計添加的樣本量為100 ng,將基因組DNA均稀釋為50 ng/μL。
加樣順序:RNase-free H2O>引物>模板>PCR Mix。
引物作為反復凍融使用的材料,在使用過程中易造成污染,導致非特異擴增。所以建議引物作為ddH2O之后優先添加的材料,防止因槍頭未更換等因素污染引物。
菌落挑取方法:在環境中用10 μL槍頭蘸取菌落后,槍頭插入溶液中,移液器按鈕從第一檔按至第二檔打出,反復吹打三次,確保菌落加入反應體系。(在透明的水中含有些微白色物質,即可確認菌落已加至反應體系中。)
菌液加樣方法:加樣前需上下顛倒混勻,用200 μL槍頭吹打混勻。
PCR反應體系:
試劑混勻
配制完成后,用桌面離心機瞬離所有試劑到管底,然后渦旋10 sec振蕩混勻,若期間有氣泡,要將氣泡輕輕指彈震裂,離心10 sec后立即上機。
若暫時不能上機,可于-20℃暫存1 h。
各擴增酶Mix PCR反應程序
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10167ES反應程序
P*反應程序
N*反應程序
V*反應程序
T*反應程序
*推薦退火溫度:60°C,也可根據自身需要設立溫度梯度摸索引物退火的最適溫度。推薦退火時間設置為20 sec,可以在10-30 sec內調節。但需注意退火時間過長可能導致擴增產物在膠上呈彌散狀。
**延伸速度設置可參考下表:本次擴增目的片段均為1 kb左右,因此設置為1 sec/kb。
如需提高產量可適當延長延伸時間,不宜超過30 sec/kb。
***循環數可設置為30-35個循環。無需再增加循環數。因為過多的循環雖然能增加產物量,但會導致非特異性產物擴增和假陽性的風險。
Tips:隨著副產物的積累以及試劑的消耗,即使再增加循環數,PCR產物量也不會再有明顯增加,出現擴增無法持續的停滯現象。10167ES試劑可以抑制【擴增無法持續的停滯現象】,無需再增加循環數,即可獲得高得率的PCR產物。
凝膠電泳
配制1%瓊脂糖凝膠插小孔梳,PCR完成后,吸取6 μL反應液上樣(翌圣PCR試劑已含有紅色示蹤染料,無需添加loading buffer,可直接上樣)。Marker使用GoldBand DL10,000 DNA Marker(10505ES),上樣4 μL。150 V電泳30 min,觀察電泳條帶。
Tips:移液槍斜角45°懸空插入膠孔中,緩慢加樣,確保玫紅色的PCR產物沉入膠孔中。避免戳破膠孔底部,導致樣品滲漏??奢p微晃動電泳槽觀察凝膠是否漏液。
電泳結果
注:1:大腸桿菌菌落;2:大腸桿菌菌液;3:小鼠基因組DNA;4:玉米基因組DNA;5:水稻基因組DNA;6:農桿菌菌落。
結果顯示,翌圣快速PCR試劑(10167ES)性能優于市面上其他競品,擴增速度快,檢出率高,擴增產量高。
以酵母菌為模板擴增3 kb目的片段比對測試
樣本前處理
用10 μL槍頭挑取酵母菌平板上的單菌落,在裝有50 μL無菌水的1.5 mL離心管中吹打三次,放入微波爐高火加熱5 min,立刻用鑷子夾取至-80℃冰箱冷卻,即獲得酵母菌前處理液。
酵母菌前處理液可以放在4度保存7天。
酵母菌平板在4度存放不得超過45天。
PCR加樣
加樣順序:RNase-free H2O>引物>酵母菌前處理液>PCR Mix。
菌液加樣方法:盡量使用新鮮處理的酵母前處理液,加樣前需解凍,震蕩10 sec混勻。
PCR反應體系:
試劑混勻
配制完成后,用桌面離心機瞬離所有試劑到管底,然后渦旋10 sec振蕩混勻,若期間有氣泡,要將氣泡輕輕指彈震裂,離心10 sec后立即上機。
若暫時不能上機,可于-20℃暫存1 h。
PCR反應程序
(同3.“各擴增酶Mix PCR反應程序"),本次擴增目的片段為3 kb左右復雜模板,因此翌圣快速PCR(Cat#10167ES)延伸速度設置為1 sec/kb。
凝膠電泳
配制1%瓊脂糖凝膠插小孔梳,PCR完成后,吸取6 μL反應液上樣。Marker使用GoldBand DL10,000 DNA Marker(10505ES),上樣4 μL。150 V電泳30 min,觀察電泳條帶。
電泳結果
結果顯示,翌圣快速PCR試劑(10167ES)酵母擴增性能優于市面上其他競品,擴增速度快,檢出率高,擴增產量高。
產品推薦:
產品定位 | 名稱 | 貨號 | 規格 |
快速PCR升級,可菌P且適用復雜模板擴增 | 2×Hieff® Ultra-Rapid II HotStart PCR Master Mix | 10167ES03/08 | 1 mL/5×1 mL |
1-7片段一步法定向連接,最快5分鐘完成重組反應 | Hieff Clone® Universal II One Step Cloning Kit | 10923ES20/50 | 20 T/50 T |
TOPO克隆-兼容TA/平末端 | Hieff Clone® Universal Zero TOPO TA/Blunt Cloning Kit | 10906ES20 | 20 T |
高保真PCR | 2× Hieff Canace® AdvanceFast PCR Master Mix (With Dye) | 10164ES03/08 | 1 mL/5×1 mL |
5 min快速完成感受態轉化 | F DH5α化學感受態 | 11803ES80 | 10×100 μL |