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恒溫擴增技術(shù),分子診斷POCT新方向

2024-12-24  閱讀(279)

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近年來,隨著分子生物學(xué)技術(shù)的迅速發(fā)展,基于核酸檢測的診斷方法已大量建立并廣泛應(yīng)用于人類疾病的實驗室檢測中。與其他的核酸擴增技術(shù)相比,等溫擴增有快速、高效、特異的優(yōu)點且無需專用的設(shè)備,所以它一經(jīng)出現(xiàn)就被許多學(xué)者認(rèn)為是一種有可能與PCR媲美的檢測方法。

因此,相信恒溫擴增技術(shù)為基礎(chǔ)的診斷儀器和試劑盒的開發(fā)和應(yīng)用將會是未來分子診斷POCT的一個新方向。

 

主流恒溫擴增技術(shù)原理介紹

 

1、LAMP環(huán)介導(dǎo)等溫擴增技術(shù)

原理:環(huán)介導(dǎo)等溫擴增(loop mediated isothermal amplification,LAMP)使用具有鏈置換特性的Bst DNA聚合酶,針對靶基因的6個區(qū)域設(shè)計4種特異引物,在等溫條件下高效、快速、特異性擴增靶標(biāo)序列,可在60-65℃進行恒溫擴增,15-60分鐘左右即可實現(xiàn)1091010倍的核酸擴增。

優(yōu)勢及應(yīng)用:等溫擴增因其反應(yīng)快速、特異高、設(shè)備簡單易操作、結(jié)果易于鑒定等優(yōu)點,已經(jīng)應(yīng)用于病原菌、寄生蟲、病毒、疾病和轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測等領(lǐng)域,并且還將廣泛應(yīng)用于臨床傳染病診斷、環(huán)境監(jiān)測、食品安全等領(lǐng)域,已經(jīng)成為一種適用于分子POCT平臺的理想方法。

分類:LAMP檢測方法分為多種,包括比濁法、pH顯色法、熒光染料法(如NHB、鈣黃綠素、SYBR Green、Syto等)、熒光探針法等。

2、RPA重組酶聚合酶擴增技術(shù)

原理:重組酶與引物結(jié)合形成的蛋白-DNA復(fù)合物,能在雙鏈DNA中尋找同源序列。一旦引物定位了同源序列,就會發(fā)生鏈交換反應(yīng)形成并啟動DNA合成,對模板上的目標(biāo)區(qū)域進行指數(shù)式擴增。被替換的DNA鏈與SSB結(jié)合,防止進一步替換。在這個體系中,由兩個相對的引物起始一個合成事件,主要依賴于重組酶、Bsu酶和SSB蛋白。可以在37~42 ℃條件下,10~30 min內(nèi)實現(xiàn)待測靶標(biāo)的快速檢測。

優(yōu)勢及應(yīng)用:它具有反應(yīng)靈敏度高、特異性強、對儀器依賴程度低且可整合多種檢測模式等優(yōu)點,特別適用于基層和現(xiàn)場即時檢測,可廣泛應(yīng)用于體外診斷、動物疫病、食品安全、生物安全、農(nóng)業(yè)等領(lǐng)域。

分類:RPA檢測方法分為多種,包括電泳法、EXO探針法、Fpg探針法、測流層析試紙條(LF-RPA)以及絮凝分析檢測等。

 

部分產(chǎn)品性能展示

 

01 pH顯色法RT-LAMP試劑

pH顯色法RT-LAMP是將可視染料作為敏感指示劑,在60-65℃等溫條件下,利用恒溫水浴鍋或普通PCR儀完成一步法RNA核酸擴增。30min即可通過反應(yīng)后顏色的變化,判斷是否感染病原體,結(jié)果更直觀(陽性為橙黃色,陰性為洋紅色)。該方法適用于大批量人群的快速檢測。

推薦產(chǎn)品:

RT-LAMP pH Sensitive Dyestuff Kit13906ES)

RT-LAMP pH Sensitive Dye Chromogenic Version Freeze-Dryable Kit13920)(可凍干版)


性能展示:

 

 

02 熒光染料法RT-LAMP試劑

熒光染料法RT-LAMP是將熒光染料(如SYBR Green、Syto等)作為熒光標(biāo)記物,在擴增反應(yīng)中與雙鏈DNA結(jié)合后,熒光信號會增強800-1000倍。使用熒光定量PCR儀在60-65℃恒溫條件下進行測試,約30min后即可通過擴增結(jié)果判斷是否感染病原體,還可搭配微流控芯片或便攜式檢測儀快速檢測。

 

推薦產(chǎn)品:RT-LAMP Dye Assay Kit(UDGplus)(13762ES)

性能展示:

 

 

RT-LAMP/RPA mix選擇指南

產(chǎn)品分類

RT-LAMP mix

RPA mix

產(chǎn)品名稱

RT-LAMP Dye Assay Kit(UDG plus)

RT-LAMP pH Sensitive Dyestuff Kit

RT-LAMP pH Sensitive Dye

Chromogenic Version

Freeze-Dryable Kit

Quick Fuse Amplifier

產(chǎn)品貨號

13762ES

13906ES

13920ES

16702ES

產(chǎn)品類別

熒光染料法

pH顯色法

pH顯色法

探針法

產(chǎn)品組份

2組份

Buffer、酶mix

3組份

Buffer、RT酶、Bst酶

4組份

Buffer、RT酶、

Bst酶、凍干保護劑

4組份

Buffer、酶mix、

醋酸鎂

支持凍干

支持,不含凍干保護劑

支持,含凍干保護劑

不支持

 

LAMP/RT-LAMP原酶選擇指南

產(chǎn)品分類

Bst酶

逆轉(zhuǎn)錄酶

UDG酶

產(chǎn)品名稱

Bst Plus

Lyophilized Bst Plus

Ⅲ Reverse Transcriptase

III Reverse Transcriptase,

Glycerol-free

UDG

UDG,Glycerol-Free

產(chǎn)品貨號

14402ES

14405ES

11111ES

11297ES

14455ES

14001ES

酶活濃度

40 U/μL

60 U/μL

200 U/μL

600 U/μL

1 U/μL

1 U/μL

產(chǎn)品組份

3組份

Buffer、酶、硫酸鎂

2組份

Bst凍干粉、復(fù)溶液

2組份

Buffer、酶

單組份

單組份

單組份

支持凍干

 

RPA原酶選擇指南

產(chǎn)品分類

Bsu聚合酶

重組酶

重組蛋白

單鏈結(jié)合蛋白

肌酸激酶

核酸外切酶

產(chǎn)品名稱

Bsu

T4 UvsX

T4 UvsY

gp 32

Creatine Kinase

Exonuclease III 

產(chǎn)品貨號

11078ES

11079ES

11080ES

11081ES

14502ES

14525ES

酶活濃度

5 U/μL

2 μg/μL

2 μg/μL

5 μg/μL

2 μg/μL

100 U/μL

產(chǎn)品組份

單組份

單組份

單組份

單組份

單組份

2組份

Buffer、酶

支持凍干

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