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全轉錄組研究
【全轉錄組測序—研究非編碼RNA與mRNA間的靶向調控以及相互作用關系】
全轉錄組高通量測序，采用去核糖體鏈特異性建庫方法和小片段富集篩選建庫方法，可實現編碼RNA和非編碼RNA的建庫、測序、信息分析及聯合分析、ceRNA等，從而快速全面準確地獲得與特定生物學過程 （例如發育、疾病等）所有RNA轉錄本數據信息，通過數據分析將生物調控機制研究延伸到“ 網、多層面"結合的立體模式，有助于相對全面解讀生物學現象。
全轉錄組測序有兩種方式，一種是LncRNA-Seq + Small RNA，另一種是LncRNA-Seq+ Small RNA+ CircRNA，可以更加全面的獲取CircRNA的信息。
兩種文庫的全轉錄組測序：LncRNA-Seq + Small RNA；
三種文庫的全轉錄組測序：LncRNA-Seq+ Small RNA+ CircRNA。
全轉錄組技術路線
全轉錄組研究原料解決方案
動物類 | 植物類 | 細菌真菌類 | ||||
樣本類型 | 動物組織/細胞 | 細胞 | 全血 | 植物組織 | 真菌組織 | 培養的細菌和真菌 |
RNA提取 | 磁珠法：18605/18607/18606 | 磁珠法：18600/18604 | 柱式法：19241 | 磁珠法：18534/18535/18537 | 磁珠法：18534/18535/18537 | 柱式法：19301（真菌需要加溶壁酶10403） |
miRNA提取 | 柱式法：19331 | 柱式法：19331 | 柱式法：19332 | 柱式法：19331 | — | — |
miRNA文庫構建 | 敬請期待 | |||||
rRNA去除 | RNaseH酶法去除：12257 | RNaseH酶法去除：12257 | RNaseH酶法去除，包含去除珠蛋白：12257+12806 RNaseH酶法去除珠蛋白：13572 | RNaseH酶法去除：12254 | 磁珠法去除：12271真菌通用型 | 磁珠法去除：12264細菌通用型/12265原核生物通用型 |
文庫構建 | 非預混RNA建庫試劑盒：12308雙模式RNA建庫試劑盒(兼容Illumina和MGI) | |||||
LncRNA研究
長鏈非編碼RNA（long non-coding RNA， LncRNA）是近年來引起廣泛關注的一種具有的調控功能的非編碼RNA。LncRNA的長度在200nt以上，不編碼蛋白，物種間保守性較差，有的序列結構與mRNA相似（含有polyA尾，存在可變剪切），有的則無這些特征。目前的研究對LncRNA的產生和功能機制尚未有明確的認識，但已有多種具有重要生物功能（如癌癥發生、X染色體沉默以及與其他調控因子作用構成復雜調控網絡等）的LncRNA被發現。
LncRNA測序技術路線
LncRNA測序原料解決方案
動物類 | 植物類 | 細菌真菌類 | ||||
樣本類型 | 動物組織/細胞 | 細胞 | 全血 | 植物組織 | 真菌組織 | 培養的細菌和真菌 |
RNA提取 | 磁珠法：18605/18607/18606 | 磁珠法：18600/18604 | 柱式法：19241 | 磁珠法：18534/18535/18537 | 磁珠法：18534/18535/18537 | 柱式法：19301（真菌需要加溶壁酶10403） |
rRNA去除 | RNaseH酶法去除：12257 | RNaseH酶法去除：12257 | RNaseH酶法去除，包含去除珠蛋白：12257+12806 RNaseH酶法去除珠蛋白：13572 | RNaseH酶法去除：12254 | 磁珠法去除：12271真菌通用型 | 磁珠法去除：12264細菌通用型/12265原核生物通用型 |
文庫構建 | 非預混RNA建庫試劑盒：12308雙模式RNA建庫試劑盒(兼容Illumina和MGI) | |||||
真核轉錄組研究
真核轉錄組研究，通過RNA-seq技術獲得特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的mRNA的總和，隨后對下機的原始數據進行拼接組裝，對基因的表達量進行統計，并進行差異分析和功能富集分析。既能獲得該物種絕大部分基因信息又能從整體水平研究基因表達差異及功能通路變化，揭示特定生物學過程的分子機制。
真核轉錄組測序技術路線
真核轉錄組測序原料解決方案
動物類 | 植物類 | 真菌類 | ||||
樣本類型 | 動物組織/細胞 | 細胞 | 全血 | 植物組織 | 真菌組織 | 培養的真菌 |
RNA提取 | 磁珠法：18605/18607/18606 | 磁珠法：18600/18604 | 柱式法：19241 | 磁珠法：18534/18535/18537 | 磁珠法：18534/18535/18537 | 柱式法：19301（加溶壁酶10403） |
mRNA捕獲 | 12629 mRNA Isolation Master Kit | |||||
文庫構建 | 非預混RNA建庫試劑盒：12308雙模式RNA建庫試劑盒(兼容Illumina和MGI) 非預混RNA建庫試劑盒-含mRNA捕獲：12309雙模式RNA建庫試劑盒(兼容Illumina和MGI) | |||||
circRNA研究
【circRNA測序—研究circRNA的差異表達如何影響生物學過程】
環狀RNA（circular RNA, circRNA）是一類特殊的非編碼RNA分析，測序采用測序平臺進行測序，針對有參考基因組樣本開展準確的circRNA鑒定以及來源基因的分析， 環狀RNA測序在醫學、農學研究領域應用越來越廣泛。基于高通量測序，依據主流數據庫和circRNA鑒定軟件，分析項目物種的circRNA信息，深入挖掘circRNA在轉錄調控中所發揮的重要功能。
circRNA測序技術路線
circRNA研究原料解決方案
動物類 | 植物類 | 細菌真菌類 | ||||
樣本類型 | 動物組織/細胞 | 細胞 | 全血 | 植物組織 | 真菌組織 | 培養的細菌和真菌 |
RNA提取 | 磁珠法：18605/18607/18606 | 磁珠法：18600/18604 | 柱式法：19241 | 磁珠法：18534/18535/18537 | 磁珠法：18534/18535/18537 | 柱式法：19301（真菌需要加溶壁酶10403） |
rRNA去除 | RNaseH酶法去除：12257 | RNaseH酶法去除：12257 | RNaseH酶法去除，包含去除珠蛋白：12257+12806 RNaseH酶法去除珠蛋白：13572 | RNaseH酶法去除：12254 | 磁珠法去除：12271真菌通用型 | 磁珠法去除：12264細菌通用型/12265原核生物通用型 |
線性RNA消化 | 14606 RNase R 去除線性RNA分子 | |||||
文庫構建 | 非預混RNA建庫試劑盒：12308雙模式RNA建庫試劑盒(兼容Illumina和MGI) | |||||
宏轉錄組
【宏轉錄組—捕捉微生態微環境活性微生物動態變化】
宏轉錄組測序：（Metatranscriptome Sequencing/ Metatranscriptomics）從整體水平研究特定環境中所有群體基因組轉錄情況和調控規律，以微生態微環境中全部RNA為研究對象， 結合高通量測序從轉錄水平研究復雜微生物群落變化，挖掘發揮功能的活性基因。
宏轉錄組研究原料解決方案
樣本類型 | 培養的細菌和真菌 | 臨床樣本 |
RNA提取 | 柱式法：19301（真菌需要加溶壁酶10403） | 柱式法：19321（病毒DNA/RNA提取） 磁珠法：18521（病毒DNA/RNA提取） 18306（病原DNA/RNA提取） |
rRNA去除 | 3 min快速去除：12258（人源去除） | |
文庫構建 | 方案1. Total RNA建庫： 12308ES雙模式RNA建庫試劑盒(兼容Illumina和MGI) 方案2. cDNA酶切建庫：13488ES cDNA合成模塊+12316ES 快速酶切法建庫試劑盒 | |
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