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背景介紹
隨著生物醫學的發展,DNA甲基化(DNA methylation)標志物在癌癥診斷、治療選擇及預后評估中的重要性日益凸顯。在現代腫瘤治療領域,腫瘤 DNA 甲基化標志物作為一種重要的生物標志物,在癌癥的早期診斷、治療選擇及預后評估中扮演著越來越關鍵的角色。
圖1.正常細胞與腫瘤細胞DNA甲基化的狀態
DNA 甲基化是一種 DNA 的共價修飾,具體是指DNA 甲基轉移酶(DNA methyltransferases,DNMTs)將甲基加到 DNA CpG 序列中胞嘧啶的 5'碳位,形成 5?甲基胞嘧啶的過程。成簇的 CpG被稱為 CpG島(CpG islands,CGIs),主要位于結構基因的啟動子和第一外顯子區域。DNA 甲基化標志物是癌細胞中的 DNA異常甲基化改變,這種異常甲基化貫穿于癌癥發生和發展的全過程。
腫瘤DNA甲基化標志物檢測及臨床應用專家共識(2024版)指出:與傳統的腫瘤標志物相比,DNA甲基化標志物具有更早期、更無創、更精準等優點。因此,可以通過非侵入性方式獲得的痰液、血漿、血清或尿液等樣本進行 DNA 甲基化標志物檢測。一些DNA甲基化異常發生在腫瘤形成的初始階段,通過檢測與腫瘤發展相關的甲基化標志物,可以輔助癌癥早期診斷、評估進展風險。DNA 甲基化標志物甲基化水平的增加或降低與腫瘤預后密切相關,可用于治療或性手術后評估腫瘤微小殘留病灶(MRD)和監測復發。此外,DNA甲基化標志物還可作為化療敏感性的標志,某些特定基因的甲基化可能預示著癌癥對治療的反應,可用于判斷化療藥物的療效,以更好地指導治療方案。
DNA甲基化標志物檢測技術方法
圖2.DNA甲基化標志物檢測技術方法
甲基化建庫試劑盒搭配MGI測序接頭一直以來為技術難點,MGI 測序接頭與 Illumina Y 字型接頭類型存在很大的差異,MGI 測序接頭 Linear adapter 與 Bubble adapter 長度不同但兩端互補配對,因此會產生小泡狀結構,小泡狀結構會降低與單鏈DNA的連接效率,影響文庫產出和檢測的靈敏度。
翌圣生物甲基化研發團隊基于創新的MGI接頭設計方式和優化接頭連接體系,開發出DNA甲基化MGI平臺文庫構建試劑盒,性能媲美于Illumina平臺文庫構建試劑盒,擁有優異的接頭連接效率,較高的文庫產出,滿足微量cfDNA樣本的甲基化建庫需求。
Hieff NGS® Methyl-seq DNA library Prep kit for MGI(Cat#12226ES)
產品簡介
Hieff NGS® Methyl-seq DNA Library Prep Kit for MGI 是針對 MGI 測序平臺專業開發設計的新一代 DNA 甲基化建庫試劑盒,可以滿足甲基化轉化后10 pg~250 ng DNA 樣本建庫。該試劑盒可兼容短至 40 bp 的 DNA 樣本,適應于先轉化后建庫。
產品亮點
投入量低:可滿足10 pg~250 ng起始量的樣本建庫
數據質量佳:不同樣本類型及不同投入量條件下均表現出優異的數據質量
操作簡便:2小時左右可以完成建庫
產品性能
MGI平臺甲基化建庫試劑12226和Illumina平臺甲基化建庫試劑12221的性能相當,MGI平臺甲基化建庫試劑12226的dup率更低。
圖3.不同樣本投入量下的文庫產量和下機數據基本指標
2、亞硫酸氫鹽轉化和酶法轉化后,采用12226建庫,不同樣本投入量下的文庫產量和下機數據基本指標
相同的樣本投入量,酶法轉化搭配MGI平臺甲基化建庫試劑12226的文庫濃度和數據質量更高,插入片段更長,文庫豐富度更高。
圖4.亞硫酸氫鹽轉化和酶法轉化后的文庫產量和下機數據基本指標
新品預告
產品名稱 | 產品貨號 | 產品應用 |
Hieff NGS® Methyl-seq DNA library Prep kit for MGI DNA 甲基化建庫MGI試劑盒 | 12226ES | 甲基化文庫構建MGI平臺 |
敲重點:申請DNA 甲基化建庫MGI試劑盒試用裝,請聯系當地銷售或技術,數量有限,試用回饋數據有獎。
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